More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1932 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.96 
 
 
345 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  40.85 
 
 
342 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  41.21 
 
 
361 aa  121  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.78 
 
 
382 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  36.45 
 
 
328 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 
338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.52 
 
 
339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.52 
 
 
339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  39.2 
 
 
355 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 
379 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  35.94 
 
 
352 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 
338 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.07 
 
 
366 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.02 
 
 
353 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.18 
 
 
355 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  37.13 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 
372 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  39.35 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  36.02 
 
 
363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  37.13 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  37.74 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  33.49 
 
 
353 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 
378 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  33.49 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  35.02 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
376 aa  115  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  38.86 
 
 
340 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  37.2 
 
 
342 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  35.29 
 
 
356 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  35.75 
 
 
360 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  35.9 
 
 
281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.1 
 
 
352 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
367 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  34.11 
 
 
339 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  35.07 
 
 
363 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  37.79 
 
 
245 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 
385 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  37.74 
 
 
527 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  38.97 
 
 
326 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  36.68 
 
 
240 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
337 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  35.51 
 
 
255 aa  114  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  32.21 
 
 
368 aa  114  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 
339 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.34 
 
 
355 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 
355 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
378 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  37.81 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.92 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  35.05 
 
 
378 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  35.05 
 
 
378 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  37.44 
 
 
396 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.7 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  34.45 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  34.69 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  34.74 
 
 
349 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  33.49 
 
 
372 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  36.99 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
358 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.76 
 
 
395 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  35.38 
 
 
357 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 
360 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  35.05 
 
 
329 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
357 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  30.84 
 
 
385 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  36.41 
 
 
343 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.51 
 
 
331 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  31.46 
 
 
372 aa  112  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
343 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
343 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  33.18 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 
336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
366 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  37.5 
 
 
309 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  33.64 
 
 
329 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  33.18 
 
 
329 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  36.04 
 
 
353 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.69 
 
 
257 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  32.11 
 
 
261 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.84 
 
 
337 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  31.78 
 
 
380 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.5 
 
 
375 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
351 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6246  ABC transporter related  36.14 
 
 
359 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836052  normal  0.532087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
382 aa  111  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  38.6 
 
 
368 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  35.41 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.71 
 
 
402 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 
376 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  36.11 
 
 
346 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  35.14 
 
 
353 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  34.78 
 
 
356 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>