More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0680 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0934  heme exporter protein CcmA  65.43 
 
 
209 aa  238  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  41.49 
 
 
208 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  35.35 
 
 
219 aa  117  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  36.61 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.29 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  36.27 
 
 
256 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2367  heme exporter protein CcmA  36.22 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  34.33 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  32.83 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
331 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  35.92 
 
 
366 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  39.68 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.57 
 
 
317 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.21 
 
 
292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  32.47 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.32 
 
 
303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  36.27 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  38.5 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.32 
 
 
331 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0236  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
247 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  29.61 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.32 
 
 
303 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.32 
 
 
331 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.32 
 
 
303 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.22 
 
 
215 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  31.49 
 
 
298 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.33 
 
 
298 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  33.16 
 
 
327 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
305 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  35.35 
 
 
246 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  35.68 
 
 
302 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.82 
 
 
303 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  33.83 
 
 
357 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.99 
 
 
316 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  32 
 
 
300 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.83 
 
 
357 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  33.5 
 
 
252 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  32.99 
 
 
344 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  37.97 
 
 
493 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  32.67 
 
 
296 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05000  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.59 
 
 
256 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.977255  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  37.3 
 
 
303 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.18 
 
 
233 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.13 
 
 
210 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.1 
 
 
234 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.13 
 
 
210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.13 
 
 
210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
305 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  35.61 
 
 
337 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  36.54 
 
 
409 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  35.36 
 
 
254 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 
309 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
297 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  34.69 
 
 
325 aa  104  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  34.04 
 
 
348 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 
333 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 
300 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 
309 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
260 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  35.29 
 
 
406 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1424  ATPase  38.16 
 
 
330 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0734659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 
205 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 
309 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.49 
 
 
245 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  33.82 
 
 
256 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1811  ABC transporter related  37.31 
 
 
311 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  34.59 
 
 
430 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
309 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
309 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  35.39 
 
 
205 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
230 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 
215 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
310 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  39.89 
 
 
229 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  35.29 
 
 
324 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  37.11 
 
 
342 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  33.51 
 
 
348 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
333 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  34.33 
 
 
353 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
309 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  37.13 
 
 
374 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  37.13 
 
 
299 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  31.61 
 
 
242 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
234 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.9 
 
 
210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  35 
 
 
333 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
309 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
333 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  33.33 
 
 
322 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
305 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  34.78 
 
 
339 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
301 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  29.56 
 
 
240 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  33.51 
 
 
348 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  29.56 
 
 
240 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  34.36 
 
 
241 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>