More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2580 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  85.77 
 
 
260 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  66.8 
 
 
256 aa  347  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.67 
 
 
244 aa  291  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  58.68 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  56.72 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  53.47 
 
 
244 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  55.04 
 
 
244 aa  276  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.22 
 
 
244 aa  275  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
244 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
246 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  54.62 
 
 
243 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.93 
 
 
239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.49 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
243 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  54.13 
 
 
242 aa  270  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  55.36 
 
 
241 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  52.28 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  54.88 
 
 
264 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  52.46 
 
 
258 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.97 
 
 
247 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 
246 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.62 
 
 
243 aa  265  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  53.65 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  54.77 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  57.98 
 
 
241 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  53.33 
 
 
240 aa  264  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
246 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  53.94 
 
 
241 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  54.22 
 
 
258 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  54.2 
 
 
247 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  52.7 
 
 
244 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  54.22 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  53.11 
 
 
250 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  54.22 
 
 
258 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.65 
 
 
254 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  53.82 
 
 
258 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  53.82 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  53.82 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  54.22 
 
 
258 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 
262 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  53.78 
 
 
271 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  52.38 
 
 
256 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  52.16 
 
 
255 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  51.88 
 
 
246 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  55.36 
 
 
241 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  53.56 
 
 
249 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  53.2 
 
 
260 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
249 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  52.65 
 
 
254 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  54.77 
 
 
241 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  52.61 
 
 
261 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  53.01 
 
 
261 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  51.13 
 
 
264 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  53.97 
 
 
253 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  52.28 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
277 aa  258  6e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  53.5 
 
 
255 aa  258  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  52.72 
 
 
241 aa  258  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  51.02 
 
 
252 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  51.05 
 
 
239 aa  257  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  51.72 
 
 
268 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 
241 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  51.88 
 
 
241 aa  257  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 
263 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  53.33 
 
 
258 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  51.59 
 
 
262 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 
268 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.84 
 
 
336 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  51.84 
 
 
253 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  51.84 
 
 
253 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
245 aa  255  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
241 aa  255  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  51.59 
 
 
262 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  51.67 
 
 
243 aa  255  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
246 aa  255  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  51.34 
 
 
265 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  53.33 
 
 
258 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  53.23 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  53.36 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  52.14 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  53.36 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  51.85 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  51.46 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  54.7 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  51.65 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  50.63 
 
 
241 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  54.2 
 
 
321 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  54.27 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>