More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1517 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  85.77 
 
 
256 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  66.27 
 
 
256 aa  340  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  53.53 
 
 
244 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
249 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
243 aa  279  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  54.36 
 
 
244 aa  276  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.51 
 
 
239 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  53.36 
 
 
244 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55 
 
 
244 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.62 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
246 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  55 
 
 
240 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 
241 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  53.36 
 
 
243 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.56 
 
 
247 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  51.45 
 
 
244 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  54.2 
 
 
240 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  55.23 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  54.77 
 
 
241 aa  265  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  53.78 
 
 
243 aa  264  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 
246 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  52.3 
 
 
254 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
242 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  53.36 
 
 
244 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
245 aa  261  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  52.1 
 
 
242 aa  261  8e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  52.08 
 
 
259 aa  261  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  54.2 
 
 
241 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
251 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  51 
 
 
252 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  52.94 
 
 
241 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  51.56 
 
 
271 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  52.72 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  52.38 
 
 
255 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  52.08 
 
 
240 aa  258  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 
246 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  52.26 
 
 
247 aa  258  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  52.1 
 
 
258 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  50.57 
 
 
268 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  51.87 
 
 
243 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  51.88 
 
 
241 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  51.88 
 
 
241 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  52.94 
 
 
254 aa  255  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 
249 aa  255  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
249 aa  255  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  52.72 
 
 
241 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  50.21 
 
 
246 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  50.42 
 
 
240 aa  255  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  52.1 
 
 
249 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  52.28 
 
 
241 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  50.21 
 
 
239 aa  254  9e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  51.61 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  52.26 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  52.85 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  50 
 
 
248 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  51.46 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 
253 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
258 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  52.52 
 
 
253 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  50.21 
 
 
243 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  50.8 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  51.45 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
262 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
336 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  51.22 
 
 
262 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  51.88 
 
 
241 aa  250  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
241 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  52.52 
 
 
253 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  51.61 
 
 
258 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  50.21 
 
 
241 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
245 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  50 
 
 
250 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.72 
 
 
241 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  53.11 
 
 
258 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 
241 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  53.94 
 
 
321 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  53.11 
 
 
258 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  49.37 
 
 
241 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  49.25 
 
 
258 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  46.62 
 
 
277 aa  248  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  49.58 
 
 
244 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  51.68 
 
 
246 aa  248  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  49.6 
 
 
256 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
247 aa  248  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  50.61 
 
 
261 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  48.65 
 
 
266 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
258 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  51.01 
 
 
261 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>