More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0679 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.51 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.67 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.25 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.32 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.67 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  55.83 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.83 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.67 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  56.07 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  56.49 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  54.32 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  55 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  54.84 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  55.88 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.76 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  53.56 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  55.14 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  54.39 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.7 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  53.56 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  55.23 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  53.97 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.39 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  54.58 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  55.65 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 277 aa  268  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.67 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  54.39 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  53.75 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  52.72 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  55.04 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  52.72 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  55.42 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  54.69 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  53.75 
 
 		 244 aa  264  8.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  55.83 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  55.83 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  52.72 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  53.23 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.81 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  52.61 
 
 		 321 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>