More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  83.33 
 
 
233 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  83.33 
 
 
234 aa  337  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  78.95 
 
 
214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  76.7 
 
 
211 aa  321  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  76.7 
 
 
210 aa  314  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  76.7 
 
 
210 aa  314  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  76.7 
 
 
210 aa  314  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  75.24 
 
 
210 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  72.6 
 
 
212 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  67.77 
 
 
215 aa  277  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.15 
 
 
226 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.28 
 
 
219 aa  203  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.99 
 
 
218 aa  201  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.99 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.5 
 
 
218 aa  197  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.99 
 
 
210 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.02 
 
 
212 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.74 
 
 
204 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.5 
 
 
206 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  45.77 
 
 
212 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  46.31 
 
 
236 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  45.45 
 
 
223 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  54.75 
 
 
188 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.03 
 
 
205 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.8 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.7 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.69 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  51.69 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  51.69 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.69 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.85 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  51.69 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.69 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.69 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.21 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.21 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.44 
 
 
217 aa  171  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  45.54 
 
 
205 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
208 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
207 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.19 
 
 
216 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
208 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
207 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
208 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
207 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
208 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
207 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.47 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.9 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.88 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.88 
 
 
216 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.47 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.88 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.88 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.16 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.88 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.88 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.16 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.39 
 
 
216 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.16 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.16 
 
 
216 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.3 
 
 
216 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.32 
 
 
204 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.26 
 
 
208 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.48 
 
 
209 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  46.67 
 
 
220 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  45.41 
 
 
215 aa  151  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  45.41 
 
 
225 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  40.41 
 
 
204 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.63 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  44.83 
 
 
201 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3256  heme exporter protein CcmA  48.86 
 
 
178 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.4 
 
 
211 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.98 
 
 
226 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  46.5 
 
 
207 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  43.35 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  41.33 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2164  heme exporter protein CcmA  39.91 
 
 
255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  47.12 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1829  ABC exporter, ATPase subunit CcmA  42.63 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.02 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.01 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  48.7 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0213  heme exporter protein CcmA  45.41 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  38.83 
 
 
210 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  43.72 
 
 
236 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1617  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  44.39 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  39.27 
 
 
228 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.8 
 
 
215 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.8 
 
 
218 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  43.2 
 
 
212 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2113  heme exporter protein CcmA  40.53 
 
 
213 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  41.36 
 
 
229 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.1 
 
 
221 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  43.84 
 
 
212 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.8 
 
 
200 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>