More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0358 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0358  ABC transporter related  100 
 
 
210 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  36.57 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  34.21 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  32.69 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  35.83 
 
 
597 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  35.5 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  34 
 
 
264 aa  114  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  36.31 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.88 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  36.7 
 
 
330 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  35.76 
 
 
885 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 
215 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.55 
 
 
888 aa  107  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  42.36 
 
 
382 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
286 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  34.17 
 
 
258 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
378 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  36 
 
 
240 aa  105  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  32.84 
 
 
223 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 
330 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  31.79 
 
 
241 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  31.02 
 
 
309 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  33.89 
 
 
230 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  31.84 
 
 
220 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0193  ABC transporter related  31.53 
 
 
647 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  36.47 
 
 
234 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  38.55 
 
 
248 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  33.51 
 
 
245 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  40.37 
 
 
361 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  33.33 
 
 
1130 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  32.16 
 
 
223 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.91 
 
 
400 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  35.96 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  35.96 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  41.79 
 
 
415 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.8 
 
 
377 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  36.02 
 
 
310 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  37.81 
 
 
250 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  33.16 
 
 
377 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  32.32 
 
 
237 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35.15 
 
 
950 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  33.84 
 
 
1090 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.8 
 
 
377 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.8 
 
 
377 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.26 
 
 
377 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  32.32 
 
 
237 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.13 
 
 
388 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  34.71 
 
 
903 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  32.81 
 
 
217 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
377 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.86 
 
 
527 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  33.73 
 
 
779 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  35.52 
 
 
290 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
263 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 
228 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  31.5 
 
 
223 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.63 
 
 
299 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0277  peptide ABC transporter ATPase  33.33 
 
 
211 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  39.04 
 
 
342 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 
664 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  35.63 
 
 
223 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  32.52 
 
 
230 aa  101  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.62 
 
 
377 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 
223 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  33.03 
 
 
664 aa  101  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2519  ABC transporter related  32.6 
 
 
231 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.989455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  31.49 
 
 
315 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.26 
 
 
310 aa  101  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
393 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
342 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0007  cell division ATP-binding protein FtsE  34.16 
 
 
231 aa  101  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  34.69 
 
 
212 aa  101  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
238 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  39.88 
 
 
353 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
381 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  34.25 
 
 
233 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  33.71 
 
 
223 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.35 
 
 
356 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 
380 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
233 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>