More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1060 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  43.04 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  44.62 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  43.88 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  36.74 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21840  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.27 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908882  normal  0.0444961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1505  ABC transporter related  38.66 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.498332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  40.1 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  44.72 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  41.38 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  39.62 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.84 
 
 		 642 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  43.37 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.31 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  36.92 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  40.72 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  43.14 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  44.39 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.48 
 
 		 642 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  39.02 
 
 		 885 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  37.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  41.09 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.66 
 
 		 893 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  35.75 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  38.69 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  39.2 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07700  cell division ATP-binding protein FtsE  43.63 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  37.09 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 643 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.12 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  44.16 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  39.5 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1385  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13119  cell division ATP-binding protein ftsE  41.62 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.762863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  36.71 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  36 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  36 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3022  cell division ATP-binding protein FtsE  42.71 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.94484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  36.54 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  37.61 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  37.61 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  37.61 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  43.41 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.2 
 
 		 357 aa  128  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  36.36 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  42.65 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0792  ABC transporter related  43.37 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  37.81 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  38.24 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  37.73 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.63 
 
 		 641 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  44.56 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  37.07 
 
 		 252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  33.63 
 
 		 641 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  37.73 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  40.19 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  33.63 
 
 		 641 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  39.8 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  37.88 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  37.1 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  37.89 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.1 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  37.05 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  42.86 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  42.86 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>