More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0792 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0792  ABC transporter related  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.07 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1555  ABC transporter related  47.26 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  38.12 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  41.26 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  40.18 
 
 		 653 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  39.19 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  42.56 
 
 		 232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.71 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  36.56 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.9 
 
 		 646 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  40.2 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  39.29 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  38.26 
 
 		 651 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  38.57 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  36.89 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  40.18 
 
 		 265 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.81 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  34.82 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.81 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.81 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  38.64 
 
 		 676 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  38.91 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  39.29 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  36.77 
 
 		 653 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  40.21 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.18 
 
 		 648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.81 
 
 		 648 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.73 
 
 		 648 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  39.73 
 
 		 283 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.81 
 
 		 648 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 648 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  39.19 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37.27 
 
 		 653 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.41 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  38.12 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  38.12 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 319 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  37.33 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  38.57 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  40.84 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  38.29 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.39 
 
 		 642 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  38.18 
 
 		 652 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  37.56 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  37.33 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  39.09 
 
 		 653 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  39.21 
 
 		 654 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  36.68 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  37.27 
 
 		 687 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  39.06 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  40.21 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.06 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 252 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  42.21 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.27 
 
 		 647 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>