More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1385 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1385  ABC transporter related protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2865  ABC transporter related  53.85 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00433012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  40.83 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  41.58 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  38.76 
 
 		 252 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  39.01 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  36.45 
 
 		 353 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  39.29 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  38.32 
 
 		 341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  35.71 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  38.39 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  40.95 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  39.37 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  38.61 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 353 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  31.46 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  38.39 
 
 		 342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0792  ABC transporter related  41.86 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  41.33 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  39.5 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  40 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  41.71 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  40.8 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  41 
 
 		 253 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  38.5 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  38.5 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  37.91 
 
 		 353 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  41.46 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 353 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  43 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 		 349 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  37.07 
 
 		 654 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  40 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  41.04 
 
 		 385 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  34.11 
 
 		 352 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  33.33 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  40.5 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  33.33 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  39.64 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  39.8 
 
 		 366 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  40.65 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  41 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  39.63 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  40.3 
 
 		 315 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1768  ABC transporter related  35.78 
 
 		 361 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.18 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 319 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40.3 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  38.57 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  35.32 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 286 aa  121  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  38.61 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  36.14 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  35.55 
 
 		 365 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.77 
 
 		 355 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  37.56 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  36.32 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  37.5 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  39 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  39 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  37.44 
 
 		 346 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  36.02 
 
 		 353 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  39 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  36.97 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  36.87 
 
 		 350 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  39.6 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.61 
 
 		 646 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  39.6 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  35.64 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  38.5 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  37.44 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>