More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2519 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2519  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.989455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 383 aa  204  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  46.33 
 
 		 365 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  46.33 
 
 		 365 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  48.17 
 
 		 366 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  45.74 
 
 		 363 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.79 
 
 		 366 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 		 393 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.16 
 
 		 362 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  45.07 
 
 		 360 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.41 
 
 		 344 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  44.04 
 
 		 346 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 381 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 393 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.41 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  45.58 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.5 
 
 		 353 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.72 
 
 		 352 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 352 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 367 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  44.04 
 
 		 346 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  43.78 
 
 		 367 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  46.54 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  45.41 
 
 		 366 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  45.12 
 
 		 352 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.05 
 
 		 352 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 371 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  44.04 
 
 		 363 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 359 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1631  ABC transporter related  44.5 
 
 		 359 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1456  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.16 
 
 		 358 aa  192  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  45.33 
 
 		 391 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  45.12 
 
 		 399 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1739  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.11345  hitchhiker  0.00063526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  47.24 
 
 		 374 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  46.46 
 
 		 379 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 350 aa  191  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.25 
 
 		 413 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  47.93 
 
 		 350 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 360 aa  191  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 360 aa  191  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  44.44 
 
 		 360 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 395 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  44.44 
 
 		 360 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  44.44 
 
 		 360 aa  191  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 1057 aa  191  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 		 364 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  42.4 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  44.7 
 
 		 354 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.73 
 
 		 376 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  46.08 
 
 		 368 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.65 
 
 		 402 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 375 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  43.58 
 
 		 353 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.04 
 
 		 353 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.8 
 
 		 356 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  44.75 
 
 		 370 aa  188  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  40.43 
 
 		 365 aa  188  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.08 
 
 		 331 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.12 
 
 		 353 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  45.41 
 
 		 585 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 376 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  43.12 
 
 		 344 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  47 
 
 		 349 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  44.09 
 
 		 370 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1694  hypothetical protein  43.58 
 
 		 363 aa  188  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 360 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.86 
 
 		 364 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.19 
 
 		 389 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  44.34 
 
 		 356 aa  187  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.37 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 360 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  43.58 
 
 		 367 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 371 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 340 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  46.08 
 
 		 365 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 		 360 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.58 
 
 		 370 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  43.81 
 
 		 387 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 387 aa  186  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  43.58 
 
 		 372 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  43.12 
 
 		 368 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 316 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 355 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  45.87 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.04 
 
 		 328 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.08 
 
 		 376 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.65 
 
 		 355 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 376 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  43.12 
 
 		 366 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 366 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.91 
 
 		 363 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>