More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1832 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  100 
 
 		 335 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  52.6 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  45.73 
 
 		 336 aa  328  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 321 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  49.85 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  49.69 
 
 		 333 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  51.67 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  47.73 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  44.31 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 341 aa  315  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  53.87 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  51.08 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  54.77 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  51.69 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  44.75 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  46.04 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  44.82 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 		 337 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  45.62 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  45.23 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.28 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  50.5 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  61.68 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  50.92 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  44.31 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  53.91 
 
 		 265 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  46.44 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  41.39 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  46.2 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  43.38 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  41.09 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  55.1 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.12 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  41.52 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  52.3 
 
 		 285 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  44.27 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  41.21 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  39.94 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 261 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  44.62 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  53.57 
 
 		 276 aa  258  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  42.51 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  43.16 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  42.9 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  40.84 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  35.49 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  46.43 
 
 		 262 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  42.9 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  42.41 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  38.23 
 
 		 326 aa  242  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  39.94 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  39.63 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  39.82 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  40.12 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  39.32 
 
 		 331 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  37.77 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  38.72 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  40.91 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  39.01 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  41.28 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  37.77 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  39.27 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33.22 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.01 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.25 
 
 		 339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.82 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.71 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>