More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2967 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2967  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0350  ABC transporter related  55.87 
 
 
239 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  48.53 
 
 
324 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  41.43 
 
 
306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.08 
 
 
305 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  38.29 
 
 
321 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
331 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.63 
 
 
301 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
302 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5934  heme exporter protein CcmA  38.96 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  33.33 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  39.34 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.03 
 
 
283 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
303 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  39.71 
 
 
305 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.94 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.72 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.81 
 
 
308 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40 
 
 
298 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  38.53 
 
 
301 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.57 
 
 
304 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
314 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.56 
 
 
304 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
333 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  38.33 
 
 
314 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.19 
 
 
320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  36.2 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.93 
 
 
320 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  36.04 
 
 
253 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  37.89 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  38.43 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.71 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.94 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  37.95 
 
 
251 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
315 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.1 
 
 
299 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  34 
 
 
350 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  38.73 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36.24 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.44 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.71 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  35.87 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  37.61 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.43 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  35.68 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  36.07 
 
 
320 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.16 
 
 
295 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  35.62 
 
 
309 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.74 
 
 
310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  38.91 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 
309 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  37.55 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.53 
 
 
301 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  33.62 
 
 
324 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
313 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 
266 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  40.09 
 
 
359 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
315 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  35.59 
 
 
327 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.81 
 
 
368 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.39 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.32 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
291 aa  131  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  38.29 
 
 
321 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  38.29 
 
 
321 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  36.65 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  38.01 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.01 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  32.38 
 
 
510 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.48 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  37.56 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  34.82 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.27 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  38.35 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  35.78 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  38.03 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  38.03 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  35.68 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.63 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  38.39 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.33 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>