More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0886 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  47.47 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  47.47 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1293  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0233393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0308  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  33.33 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  32.19 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.93 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  29.27 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  33.64 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  31.62 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  32.86 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  29.68 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  33.48 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.63 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  26.95 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  29.93 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.68 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  32.24 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  29.91 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  28.1 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  31.46 
 
 		 374 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  27.92 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  30.19 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  29.92 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  28.51 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  29.29 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  29.91 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  31.94 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  29.09 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  33.33 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  30.04 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  30.99 
 
 		 388 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  29.41 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  31.05 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  29.95 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  29.68 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  30 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  28.7 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  26.51 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  27.49 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  33.61 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  27.92 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  34.95 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  32.33 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  31.63 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  28.66 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.13 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  28.68 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  32.41 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  27.74 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2967  ABC transporter related  32.86 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  30.17 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  32.51 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  31.9 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  31.39 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  31.2 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  26.92 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  29.61 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.57 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  31.98 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  31.98 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  31.37 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  31.75 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  28.91 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  28.91 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>