More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0350 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0350  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2967  ABC transporter related  55.87 
 
 
266 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
301 aa  205  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  54.63 
 
 
324 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.7 
 
 
301 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  42.92 
 
 
301 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  41.44 
 
 
301 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.33 
 
 
298 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.33 
 
 
299 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  42.92 
 
 
306 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.4 
 
 
305 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
310 aa  148  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  40.25 
 
 
301 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.94 
 
 
301 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
333 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.72 
 
 
304 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  37.86 
 
 
302 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
316 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
331 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.12 
 
 
303 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  38.43 
 
 
318 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.81 
 
 
303 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  32.79 
 
 
311 aa  141  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  32.57 
 
 
283 aa  141  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  36.53 
 
 
344 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 
322 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.86 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  37.28 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  37.28 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
309 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  39.45 
 
 
321 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  38.64 
 
 
320 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  38.32 
 
 
284 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  36.21 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.86 
 
 
308 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  38.43 
 
 
310 aa  136  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  34.19 
 
 
297 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.55 
 
 
302 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
302 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.64 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  38.53 
 
 
373 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38.64 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  37.44 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  38.4 
 
 
330 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.89 
 
 
313 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
332 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.44 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  38.05 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.44 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  38.84 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 
368 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36.64 
 
 
304 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  37.65 
 
 
301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  40.09 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  38.99 
 
 
324 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.05 
 
 
292 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
300 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
306 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  37.14 
 
 
316 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  40.72 
 
 
304 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  39.09 
 
 
304 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
313 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  37.95 
 
 
320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
332 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
304 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
337 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.88 
 
 
310 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 
343 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  37.5 
 
 
304 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  35.96 
 
 
308 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.01 
 
 
304 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  38.64 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  34.72 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
301 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  35.11 
 
 
310 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 
316 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.96 
 
 
291 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.2 
 
 
293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.77 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  38.12 
 
 
318 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  37.87 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  31.84 
 
 
303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 
300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  36.67 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  37.07 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>