More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1484 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1484  ABC transporter related  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0931  ABC transporter related  86.39 
 
 		 203 aa  333  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0622684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.13 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  36.13 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  36.13 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  36.13 
 
 		 303 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  38.1 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.6 
 
 		 303 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 331 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.6 
 
 		 303 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.08 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.22 
 
 		 304 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  37.29 
 
 		 304 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  39.58 
 
 		 323 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.04 
 
 		 316 aa  104  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  32.49 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  37.16 
 
 		 318 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  36.31 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  38.46 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  39.89 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  38.46 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  39.43 
 
 		 305 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  33.98 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0236  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3953  ABC transporter related  35.39 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00887978  normal  0.0604137 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  33.82 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  34.59 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  38.86 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 		 323 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6992  ABC transporter related  37.23 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03770  heme exporter protein CcmA  36.36 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.59 
 
 		 310 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.64 
 
 		 365 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 307 aa  98.6  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 		 323 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  36.45 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  30.69 
 
 		 241 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  30.2 
 
 		 241 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  35.64 
 
 		 247 aa  98.2  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 316 aa  98.2  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 		 357 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 310 aa  98.2  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  35.16 
 
 		 252 aa  97.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  35.47 
 
 		 298 aa  97.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  33.5 
 
 		 242 aa  97.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 		 380 aa  97.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.11 
 
 		 313 aa  97.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  32.46 
 
 		 307 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 		 337 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  34.13 
 
 		 266 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  39.53 
 
 		 302 aa  97.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  35 
 
 		 324 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 308 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  32.02 
 
 		 242 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 307 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  34.05 
 
 		 348 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  38.51 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.59 
 
 		 350 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.36 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.42 
 
 		 304 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 310 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 332 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 321 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04340  ABC transporter related  32.72 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  35.78 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1418  ABC transporter related  32.62 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  39.88 
 
 		 328 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  35.64 
 
 		 291 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  35.78 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  39.89 
 
 		 341 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.03 
 
 		 349 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  36.36 
 
 		 325 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 301 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 		 369 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  31.75 
 
 		 301 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  35.78 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  32.77 
 
 		 339 aa  95.5  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1742  ABC transporter related  40.1 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.602856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 301 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  35.45 
 
 		 359 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.98 
 
 		 307 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.98 
 
 		 307 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.98 
 
 		 307 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 307 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  38.42 
 
 		 3786 aa  95.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.98 
 
 		 307 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  33.72 
 
 		 254 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.77 
 
 		 312 aa  95.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.68 
 
 		 309 aa  95.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 241 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 		 360 aa  94.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>