More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1708 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  100 
 
 
323 aa  627  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  46.18 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  45.81 
 
 
322 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  48.12 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  44.74 
 
 
322 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  43.9 
 
 
325 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  49.54 
 
 
322 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  41.44 
 
 
297 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42 
 
 
312 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  44.65 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  36.42 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 
306 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  42.44 
 
 
309 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  42.44 
 
 
309 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  35.1 
 
 
306 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  34.8 
 
 
315 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  41.63 
 
 
245 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  34.95 
 
 
315 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 
308 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  40.07 
 
 
308 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  39.92 
 
 
306 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  35.78 
 
 
311 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  42.41 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  35.43 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  35.29 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  36.19 
 
 
314 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  36.19 
 
 
314 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  33.44 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  35.14 
 
 
307 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  35.91 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
308 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.91 
 
 
339 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  34.62 
 
 
308 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  35.31 
 
 
306 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  34.44 
 
 
308 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  36.9 
 
 
321 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  32.01 
 
 
308 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.58 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  36.16 
 
 
250 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  34.89 
 
 
329 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  37.58 
 
 
309 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  34.44 
 
 
308 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  36.1 
 
 
314 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  43.64 
 
 
309 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
309 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
314 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  38.72 
 
 
306 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  37.97 
 
 
303 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  35.78 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  29.9 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  43.26 
 
 
309 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
309 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  35.53 
 
 
318 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
314 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
312 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  32.35 
 
 
309 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
312 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
316 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  42.59 
 
 
283 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.55 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  37.34 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  40.77 
 
 
301 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  36.18 
 
 
308 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  41.92 
 
 
318 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  39.41 
 
 
310 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  34.54 
 
 
308 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  36.56 
 
 
309 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.17 
 
 
320 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  42.02 
 
 
310 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  30.58 
 
 
320 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  35.99 
 
 
317 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  37.8 
 
 
240 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  39.83 
 
 
326 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1559  ABC transporter related  40.37 
 
 
284 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  34.73 
 
 
320 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  39.53 
 
 
308 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  34.19 
 
 
315 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  34.32 
 
 
318 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 
339 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  39.66 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  34.92 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.67 
 
 
308 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.11 
 
 
312 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  40.09 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  36.81 
 
 
322 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  36.04 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  35.95 
 
 
320 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 
310 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  37.12 
 
 
387 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  40 
 
 
306 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>