More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6992 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6992  ABC transporter related  100 
 
 
279 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3953  ABC transporter related  53.38 
 
 
299 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00887978  normal  0.0604137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
311 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.86 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
312 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
312 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
312 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
312 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.61 
 
 
337 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  39.82 
 
 
312 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  33 
 
 
321 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  42.36 
 
 
311 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  42.86 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 
310 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  42.08 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  37.5 
 
 
250 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  43.72 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.17 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  43.78 
 
 
250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.26 
 
 
320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.54 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  42.38 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  45.62 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  45.62 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.86 
 
 
348 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  42.86 
 
 
321 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  45.16 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.16 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  42.86 
 
 
321 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  43.72 
 
 
298 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
336 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.75 
 
 
310 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  40.58 
 
 
308 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.75 
 
 
310 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
321 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  36.59 
 
 
319 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.03 
 
 
316 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
308 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
316 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  39.24 
 
 
302 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 
342 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.56 
 
 
338 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35 
 
 
339 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35 
 
 
339 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  32.06 
 
 
301 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 
312 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  36.92 
 
 
315 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
310 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  34.75 
 
 
257 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.33 
 
 
332 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.24 
 
 
308 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.19 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  35.17 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 
334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  35.98 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  31.71 
 
 
305 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.35 
 
 
312 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  34.55 
 
 
339 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38 
 
 
351 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  36.49 
 
 
338 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.46 
 
 
304 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  37.59 
 
 
284 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38.85 
 
 
337 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  41.59 
 
 
308 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.23 
 
 
319 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  34.89 
 
 
309 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.11 
 
 
304 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  36.91 
 
 
337 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  36.36 
 
 
304 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.26 
 
 
345 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.29 
 
 
297 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
337 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  38.6 
 
 
311 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.59 
 
 
338 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.78 
 
 
337 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  36.65 
 
 
240 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.91 
 
 
337 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  32.13 
 
 
287 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
449 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  31.35 
 
 
310 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
323 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  35.86 
 
 
319 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  36.45 
 
 
311 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
343 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  35.15 
 
 
299 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.84 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>