More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3635 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  100 
 
 		 322 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  90.99 
 
 		 322 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  90.06 
 
 		 322 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  68.47 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  59.02 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  43.48 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  43.79 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  39.73 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  37.39 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.96 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  37.61 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.18 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.45 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.86 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  43.2 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  36.97 
 
 		 251 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.22 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  41.74 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  41.1 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  36.16 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.88 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.38 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  36.68 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  42.45 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  36.49 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  43.4 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.93 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  36.49 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  33.88 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  39.21 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4875  ABC transporter related  41.22 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.15 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.68 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  35.97 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  35.64 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.64 
 
 		 338 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  39.38 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  37.97 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  40.18 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.64 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4993  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.09 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.68 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  35.74 
 
 		 306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  42.73 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  34.27 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  38.92 
 
 		 245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.6 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  36.86 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  31.86 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.27 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 411 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.19 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  35.84 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  32.49 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  41.5 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  41.5 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  39.9 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  39.65 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  35.31 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  40.79 
 
 		 3786 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  30.54 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  35.84 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  35.57 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.76 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.51 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.83 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.36 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  35.31 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.28 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.12 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  35.64 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  43.5 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  43.5 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  38.11 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.46 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  32.49 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>