More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1793 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  76.79 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  75.42 
 
 		 237 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  61.7 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  55.93 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  54.75 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  51.05 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  48.52 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  48.1 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  49.37 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  49.14 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  49.37 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  49.58 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  47.84 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  46.86 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  46.84 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  46.55 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  43.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  45.34 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  45.19 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  43.1 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  45.38 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  47.03 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.07 
 
 		 338 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  40.95 
 
 		 576 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 541 aa  168  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  45.11 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.12 
 
 		 325 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.35 
 
 		 312 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.5 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  41.1 
 
 		 582 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 325 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 326 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 334 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 578 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.83 
 
 		 578 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 578 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.77 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 578 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  35.83 
 
 		 578 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  35.83 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  37.97 
 
 		 581 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  34.31 
 
 		 580 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 580 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 		 329 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 		 321 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  38.59 
 
 		 585 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  40.36 
 
 		 315 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  40.59 
 
 		 578 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  37.45 
 
 		 906 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 583 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.24 
 
 		 590 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.45 
 
 		 906 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.66 
 
 		 590 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.46 
 
 		 588 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 589 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  37.45 
 
 		 906 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  35.15 
 
 		 582 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 323 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 585 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.82 
 
 		 593 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.84 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 		 579 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  35.93 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 578 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  35.56 
 
 		 579 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 578 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 		 578 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  40.25 
 
 		 580 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.15 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 578 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 312 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 312 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 312 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 		 312 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 		 312 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 327 aa  158  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 311 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 578 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.15 
 
 		 259 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.5 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>