More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3152 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  100 
 
 		 318 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  68.81 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  68.14 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  68.47 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  62.63 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  48.12 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  42.95 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  40.21 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.17 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.18 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  32.79 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  39.9 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  42.58 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.19 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  36.71 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.63 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.81 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  38.46 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  32.99 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.2 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  36.51 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.99 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  39.41 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  35.69 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.18 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.11 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.04 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  37.18 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  39.27 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.13 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  36.57 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.18 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.22 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.08 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.12 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  36.02 
 
 		 249 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  34.34 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  46.58 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  46.58 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  37.81 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.94 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  37.44 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  36.25 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.6 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.58 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.19 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.49 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  36.02 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  36.1 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  34.91 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  35.81 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.48 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.23 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  39.27 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.69 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  32.24 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  36.36 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  29.34 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  41.01 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  36.74 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  35.92 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  39.34 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  42.72 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  34.97 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  39.24 
 
 		 922 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  37.44 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  39.07 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  35.14 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  35.92 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.36 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  42.44 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  39.35 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  37.34 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.54 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  38.05 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  37.42 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.44 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  39.34 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  35 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>