More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3748 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  100 
 
 
322 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  98.45 
 
 
322 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  90.06 
 
 
322 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  68.14 
 
 
318 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  57.38 
 
 
325 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  45.28 
 
 
323 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  42.81 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  38.97 
 
 
315 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  32.78 
 
 
297 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  38.59 
 
 
245 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
311 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  36.68 
 
 
250 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
320 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  36.7 
 
 
249 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
316 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.08 
 
 
331 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.18 
 
 
337 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 
317 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.72 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  40 
 
 
315 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  41.18 
 
 
341 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.05 
 
 
345 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.77 
 
 
362 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.61 
 
 
310 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  35.95 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  40.45 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.86 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  31.85 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4875  ABC transporter related  40.17 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.76 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  42.03 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  38.18 
 
 
245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0960  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
265 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00252533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  42.18 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  36.28 
 
 
308 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 
314 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  38.59 
 
 
286 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  38.76 
 
 
310 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  36.32 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  37.13 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.15 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.44 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.1 
 
 
310 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  39.56 
 
 
306 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  35.84 
 
 
308 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
308 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  36.28 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.89 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.68 
 
 
320 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
306 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  35.86 
 
 
308 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  35.69 
 
 
306 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  39.91 
 
 
319 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.3 
 
 
331 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  36.19 
 
 
304 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.79 
 
 
313 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  45.64 
 
 
283 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4993  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 
349 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949758  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
275 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  35.06 
 
 
302 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.67 
 
 
296 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0541  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
265 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
246 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.55 
 
 
310 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
449 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  35.43 
 
 
327 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 
338 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  42.73 
 
 
311 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
342 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  38.65 
 
 
345 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  36.01 
 
 
333 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.49 
 
 
305 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  34.63 
 
 
318 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  43.9 
 
 
302 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  40.48 
 
 
304 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
311 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.11 
 
 
284 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  40.48 
 
 
304 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.76 
 
 
304 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  32.8 
 
 
313 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  34.91 
 
 
306 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.77 
 
 
368 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.59 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.34 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  37.18 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.15 
 
 
756 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  39.44 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  35.28 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  42.45 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  42.45 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  33.99 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  39.52 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>