100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2881 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  76.82 
 
 		 619 aa  985    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  55.52 
 
 		 615 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  77.65 
 
 		 618 aa  1003    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  54.63 
 
 		 615 aa  700    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  79.13 
 
 		 621 aa  1017    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  94.69 
 
 		 622 aa  1219    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 622 aa  1299    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  56.12 
 
 		 615 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  37.86 
 
 		 624 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.5 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  22.05 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  22.25 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.43 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.14 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  27.44 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  23.49 
 
 		 716 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.49 
 
 		 716 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.49 
 
 		 716 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.76 
 
 		 730 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  26.37 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  27.36 
 
 		 566 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.58 
 
 		 682 aa  53.9  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  24.56 
 
 		 682 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.57 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.63 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  24.6 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.83 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.24 
 
 		 716 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.05 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  26.27 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.44 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.68 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  22.94 
 
 		 749 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.74 
 
 		 722 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  29.03 
 
 		 572 aa  52  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.44 
 
 		 716 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  24.1 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  26.26 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.2 
 
 		 716 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.84 
 
 		 718 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  22.98 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.78 
 
 		 725 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.37 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  28.38 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.28 
 
 		 742 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.34 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.28 
 
 		 742 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.54 
 
 		 671 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  25.54 
 
 		 679 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.18 
 
 		 736 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  21.75 
 
 		 681 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  21.93 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.06 
 
 		 717 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  26.13 
 
 		 563 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  25.79 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  27.59 
 
 		 697 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.04 
 
 		 696 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  26.13 
 
 		 563 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.04 
 
 		 692 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.55 
 
 		 742 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  22.82 
 
 		 676 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  23.16 
 
 		 674 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.73 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.73 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.73 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  25.52 
 
 		 548 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  22.61 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.12 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.73 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.29 
 
 		 689 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.26 
 
 		 726 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.59 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  21.73 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.35 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  23.36 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  22.34 
 
 		 694 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.3 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  21.29 
 
 		 694 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.36 
 
 		 678 aa  45.8  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.1 
 
 		 729 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  22.06 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  22.06 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.17 
 
 		 672 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  24.41 
 
 		 780 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  27.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  27.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  22.45 
 
 		 507 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  27.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  27.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  27.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  22.06 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  31.4 
 
 		 714 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  25.35 
 
 		 712 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.1 
 
 		 726 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  23.49 
 
 		 563 aa  44.3  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  27.27 
 
 		 680 aa  44.3  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.87 
 
 		 720 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.94 
 
 		 674 aa  43.9  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.7 
 
 		 672 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  39.62 
 
 		 597 aa  43.9  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>