247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0146 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  59.56 
 
 
548 aa  688    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  61.22 
 
 
548 aa  696    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 
569 aa  1159    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  42.76 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  42.94 
 
 
577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  41.48 
 
 
571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  41.59 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  38.85 
 
 
566 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  38.29 
 
 
572 aa  412  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  39.41 
 
 
563 aa  356  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  38.29 
 
 
563 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  36.95 
 
 
563 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  37.75 
 
 
563 aa  332  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  37.39 
 
 
563 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  36.75 
 
 
563 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  36.57 
 
 
563 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  35.96 
 
 
563 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  35.96 
 
 
563 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  35.93 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.03 
 
 
561 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  34.38 
 
 
578 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  33.58 
 
 
548 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  34.01 
 
 
548 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  33.89 
 
 
548 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  32.26 
 
 
570 aa  263  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  33.33 
 
 
548 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  32.41 
 
 
548 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  32.41 
 
 
548 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  32.78 
 
 
548 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  34.55 
 
 
565 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  30.74 
 
 
576 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  33.8 
 
 
564 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  33.8 
 
 
564 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  34.04 
 
 
564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  42.71 
 
 
305 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  32.48 
 
 
564 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  31.24 
 
 
564 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  31 
 
 
564 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  30.77 
 
 
564 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  31 
 
 
564 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  30.77 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  30.4 
 
 
554 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  29.14 
 
 
564 aa  210  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  29.47 
 
 
565 aa  206  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  28.29 
 
 
564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  29.21 
 
 
567 aa  190  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  26.46 
 
 
555 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  33.71 
 
 
297 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  25.78 
 
 
622 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  24.68 
 
 
596 aa  93.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  24.7 
 
 
619 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  24.82 
 
 
620 aa  91.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  24.82 
 
 
620 aa  91.3  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.83 
 
 
573 aa  90.9  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.97 
 
 
601 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.61 
 
 
591 aa  90.5  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.58 
 
 
620 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  25.84 
 
 
599 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.46 
 
 
625 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.67 
 
 
612 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.46 
 
 
625 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  22.36 
 
 
569 aa  87.8  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  25.81 
 
 
593 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  25.06 
 
 
598 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.47 
 
 
617 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  26.18 
 
 
618 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.48 
 
 
597 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 
603 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.21 
 
 
617 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  26.46 
 
 
597 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.12 
 
 
627 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  26.12 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  24.81 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  26.12 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  22.92 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  25.32 
 
 
602 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  25.87 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.08 
 
 
620 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.54 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  22.9 
 
 
597 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.25 
 
 
616 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.71 
 
 
638 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  24.53 
 
 
600 aa  78.6  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.3 
 
 
623 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.71 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  24.56 
 
 
599 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  27.38 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.24 
 
 
622 aa  77  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  22.68 
 
 
571 aa  77  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1092  oligopeptidase F  24.2 
 
 
600 aa  76.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.606677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  31.19 
 
 
233 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.81 
 
 
616 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  24.76 
 
 
664 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.64 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.36 
 
 
589 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>