162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2943 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  53.56 
 
 
576 aa  666    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  61.52 
 
 
564 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  763    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  64.41 
 
 
564 aa  791    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  763    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  61.57 
 
 
564 aa  761    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  56.56 
 
 
564 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  56.38 
 
 
564 aa  693    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  61.35 
 
 
564 aa  762    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  61.35 
 
 
564 aa  758    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  62.06 
 
 
564 aa  771    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 
564 aa  1177    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  61.52 
 
 
564 aa  763    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  50 
 
 
565 aa  587  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  49.47 
 
 
567 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  45.57 
 
 
565 aa  508  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  41.29 
 
 
554 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  38.13 
 
 
555 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  27.99 
 
 
577 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  28.29 
 
 
569 aa  209  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  28.65 
 
 
577 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  26.38 
 
 
563 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  26.99 
 
 
563 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  26.51 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  26.51 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  26.18 
 
 
563 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  27.74 
 
 
563 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  26.57 
 
 
571 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 
563 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  27.51 
 
 
563 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  27.69 
 
 
548 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  28.15 
 
 
580 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  27.34 
 
 
572 aa  194  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  28.13 
 
 
548 aa  194  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  26.92 
 
 
563 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 
563 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  25.15 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.51 
 
 
561 aa  183  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  30.08 
 
 
570 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  26.52 
 
 
305 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  21.57 
 
 
578 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  23.87 
 
 
548 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  21.94 
 
 
548 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  21.74 
 
 
548 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  21.74 
 
 
548 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  21.68 
 
 
548 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  21.68 
 
 
548 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  21.34 
 
 
548 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.93 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  21.87 
 
 
622 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  23.59 
 
 
619 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  25 
 
 
297 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.21 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  21.36 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.35 
 
 
603 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1648  oligoendopeptidase F  23.77 
 
 
599 aa  62  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  21.93 
 
 
590 aa  61.6  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.12 
 
 
608 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.78 
 
 
601 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  22.42 
 
 
577 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.34 
 
 
616 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  24.51 
 
 
593 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.85 
 
 
607 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  27.14 
 
 
602 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  27.14 
 
 
602 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  21.56 
 
 
629 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.1 
 
 
612 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  28.3 
 
 
609 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.49 
 
 
620 aa  58.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.24 
 
 
588 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  32.14 
 
 
596 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0580  oligoendopeptidase F  27.75 
 
 
602 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.970451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.02 
 
 
612 aa  57.4  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.81 
 
 
588 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.57 
 
 
615 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1446  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.52 
 
 
610 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  19.76 
 
 
620 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  20.49 
 
 
664 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  21.54 
 
 
597 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  19.76 
 
 
620 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  20.96 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.46 
 
 
598 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.46 
 
 
591 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.1 
 
 
586 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  22.59 
 
 
573 aa  55.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  21.75 
 
 
619 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  21.46 
 
 
599 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  22.25 
 
 
603 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.99 
 
 
623 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  20.66 
 
 
597 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.32 
 
 
617 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.22 
 
 
617 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.95 
 
 
589 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1090  oligoendopeptidase F  22.55 
 
 
631 aa  54.3  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.74 
 
 
584 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  22.57 
 
 
569 aa  53.9  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>