247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2980 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  100 
 
 
622 aa  1283    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.87 
 
 
609 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  24.21 
 
 
603 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.83 
 
 
622 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  25.39 
 
 
597 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  25.62 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  24.3 
 
 
619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  25.74 
 
 
600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  24.53 
 
 
599 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  24.22 
 
 
599 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  25.38 
 
 
608 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  24.96 
 
 
598 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  24.51 
 
 
595 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  24.34 
 
 
595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  22.54 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 
608 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  26.68 
 
 
601 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 
608 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  24.87 
 
 
608 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  24.16 
 
 
595 aa  140  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  24.87 
 
 
608 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  24.08 
 
 
595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  23.87 
 
 
602 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  23.63 
 
 
595 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  24.23 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  23.87 
 
 
618 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  23.26 
 
 
597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.79 
 
 
603 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  23.81 
 
 
595 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2201  oligoendopeptidase F  23.47 
 
 
595 aa  134  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  24.35 
 
 
604 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  24.18 
 
 
607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  25.24 
 
 
592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  23.8 
 
 
602 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  23.8 
 
 
602 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1361  oligoendopeptidase F  24.01 
 
 
613 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  22.96 
 
 
600 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4751  oligoendopeptidase F  23.4 
 
 
605 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.16 
 
 
578 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  25.35 
 
 
590 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  21.4 
 
 
599 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.6 
 
 
606 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  24.95 
 
 
603 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  23.9 
 
 
596 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  22.11 
 
 
603 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.19 
 
 
591 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  22.02 
 
 
602 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3366  oligoendopeptidase F  23.62 
 
 
606 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  22.68 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1084  oligoendopeptidase F  22.81 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.450155  normal  0.585135 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  23.03 
 
 
604 aa  122  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.63 
 
 
592 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0580  oligoendopeptidase F  23.1 
 
 
602 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.970451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  27.17 
 
 
573 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  26.32 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  22.27 
 
 
594 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  24.06 
 
 
629 aa  117  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  29.75 
 
 
573 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  22.42 
 
 
620 aa  117  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1090  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 
631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  22.72 
 
 
619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.3 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.42 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.75 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  28.19 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  30.6 
 
 
572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1161  oligoendopeptidase F  21.47 
 
 
596 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0130  oligoendopeptidase F  21.22 
 
 
604 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000121565  hitchhiker  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.23 
 
 
601 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  22.26 
 
 
620 aa  114  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  23.42 
 
 
599 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  23 
 
 
606 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  21.31 
 
 
606 aa  114  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.39 
 
 
620 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  30.04 
 
 
573 aa  113  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.81 
 
 
622 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.33 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1306  oligoendopeptidase F  21.75 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479307  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.5 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  25.78 
 
 
601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1115  oligoendopeptidase F  22.71 
 
 
604 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.91 
 
 
588 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  23.3 
 
 
597 aa  112  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  22.6 
 
 
649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  22.84 
 
 
646 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  22.12 
 
 
601 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.6 
 
 
589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  23.02 
 
 
654 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.11 
 
 
601 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.44 
 
 
597 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>