271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1242 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  59.15 
 
 		 573 aa  691    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  100 
 
 		 573 aa  1176    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  56.92 
 
 		 571 aa  675    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  57.72 
 
 		 573 aa  674    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  66.84 
 
 		 573 aa  789    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  97.91 
 
 		 573 aa  1131    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  58.17 
 
 		 569 aa  694    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  98.6 
 
 		 572 aa  1132    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  54.67 
 
 		 566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.07 
 
 		 601 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.39 
 
 		 622 aa  402  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.72 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.11 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.38 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.08 
 
 		 616 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.49 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.14 
 
 		 620 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  36.49 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.24 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.58 
 
 		 601 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  36.22 
 
 		 619 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.84 
 
 		 625 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.15 
 
 		 615 aa  379  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.96 
 
 		 625 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  34.13 
 
 		 620 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  34.3 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.94 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.08 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.84 
 
 		 614 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.79 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.16 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.04 
 
 		 617 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.24 
 
 		 616 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.23 
 
 		 617 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  34.19 
 
 		 664 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.91 
 
 		 610 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.4 
 
 		 626 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.52 
 
 		 632 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.13 
 
 		 606 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.57 
 
 		 606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  35.05 
 
 		 606 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.97 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.08 
 
 		 620 aa  350  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.88 
 
 		 606 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.13 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.73 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  34.59 
 
 		 596 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.66 
 
 		 638 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.71 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.54 
 
 		 589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.29 
 
 		 612 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.65 
 
 		 625 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.73 
 
 		 588 aa  329  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.39 
 
 		 588 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  33.33 
 
 		 611 aa  323  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.44 
 
 		 608 aa  319  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.71 
 
 		 591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.85 
 
 		 603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.51 
 
 		 578 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.98 
 
 		 590 aa  292  9e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.86 
 
 		 584 aa  253  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  29.25 
 
 		 601 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  31.83 
 
 		 577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.74 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  30.15 
 
 		 597 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.5 
 
 		 597 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.92 
 
 		 593 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  28.21 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.82 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.11 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  25.6 
 
 		 619 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  25.04 
 
 		 609 aa  176  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.12 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  29.96 
 
 		 600 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  28.47 
 
 		 595 aa  170  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  26.29 
 
 		 622 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.6 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  28.23 
 
 		 600 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  27.5 
 
 		 606 aa  169  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  25.73 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  25.5 
 
 		 601 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  27.89 
 
 		 590 aa  166  9e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  28.54 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  27.38 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  26.69 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  26.67 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  25.39 
 
 		 593 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  26.72 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.06 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  26.23 
 
 		 602 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  26.23 
 
 		 602 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  27.33 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  26.36 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  26.91 
 
 		 601 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  28.71 
 
 		 602 aa  160  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  23.8 
 
 		 644 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  29.25 
 
 		 599 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  24.58 
 
 		 608 aa  158  3e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  26.26 
 
 		 605 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  25.82 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>