More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0884 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 578 aa  1170    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  44.08 
 
 		 584 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  35.11 
 
 		 612 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.62 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  36.01 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.79 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.74 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.04 
 
 		 589 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.28 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 573 aa  329  8e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.94 
 
 		 590 aa  317  5e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.82 
 
 		 601 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.75 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.83 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  33.74 
 
 		 572 aa  294  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.93 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  32.01 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  33.05 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  32.68 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  33.51 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  33.51 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.68 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.52 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  31.42 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.94 
 
 		 597 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  31.89 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.42 
 
 		 625 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.59 
 
 		 616 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.71 
 
 		 614 aa  269  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  32.08 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.07 
 
 		 625 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.11 
 
 		 620 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.27 
 
 		 616 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.89 
 
 		 617 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  30.93 
 
 		 620 aa  263  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.86 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  30.93 
 
 		 620 aa  261  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.35 
 
 		 617 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.98 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.81 
 
 		 616 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.03 
 
 		 634 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.27 
 
 		 620 aa  256  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.82 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.15 
 
 		 623 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.91 
 
 		 627 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.83 
 
 		 597 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  29.66 
 
 		 664 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.51 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.17 
 
 		 608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.89 
 
 		 615 aa  242  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  29.77 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  29.78 
 
 		 626 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  29.42 
 
 		 610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.84 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.53 
 
 		 606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  31.65 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.88 
 
 		 626 aa  233  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  29.06 
 
 		 632 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.6 
 
 		 638 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  29.98 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.88 
 
 		 625 aa  227  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  30.61 
 
 		 611 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.11 
 
 		 606 aa  226  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.58 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.39 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  28.01 
 
 		 592 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.64 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  29.07 
 
 		 595 aa  210  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.9 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.99 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.68 
 
 		 603 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  27.65 
 
 		 608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.33 
 
 		 603 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  27.62 
 
 		 600 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  28.4 
 
 		 596 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  26.95 
 
 		 622 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  29.47 
 
 		 590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  27.16 
 
 		 598 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  28.05 
 
 		 599 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  25.55 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  28.05 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  24.66 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  30.56 
 
 		 601 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  27.26 
 
 		 601 aa  183  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  28.09 
 
 		 604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  30.74 
 
 		 602 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  26.53 
 
 		 601 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  28.19 
 
 		 606 aa  180  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1161  oligoendopeptidase F  25.72 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  24.74 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  24.91 
 
 		 605 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  27.06 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.88 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  25.88 
 
 		 597 aa  177  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  26.61 
 
 		 599 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  25.18 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  26.81 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  25.24 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  25.84 
 
 		 603 aa  174  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  26.15 
 
 		 604 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>