237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0066 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  56.18 
 
 		 566 aa  640    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  59.15 
 
 		 573 aa  678    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  59.68 
 
 		 573 aa  680    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  100 
 
 		 573 aa  1173    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  77.07 
 
 		 571 aa  920    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  57.44 
 
 		 573 aa  684    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  64.73 
 
 		 569 aa  776    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  59.68 
 
 		 572 aa  678    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  58.81 
 
 		 573 aa  693    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.23 
 
 		 601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.61 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.52 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  36.52 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.9 
 
 		 616 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.38 
 
 		 615 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.58 
 
 		 620 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.71 
 
 		 616 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.62 
 
 		 622 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.68 
 
 		 597 aa  359  9e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.7 
 
 		 620 aa  359  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.54 
 
 		 623 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  37.46 
 
 		 612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.08 
 
 		 616 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.66 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  35.14 
 
 		 620 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  35.14 
 
 		 620 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.58 
 
 		 625 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.91 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  35.05 
 
 		 610 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  36.02 
 
 		 619 aa  352  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.9 
 
 		 625 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.74 
 
 		 601 aa  352  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.19 
 
 		 617 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  35.46 
 
 		 596 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.47 
 
 		 632 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.96 
 
 		 634 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.33 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  34.54 
 
 		 664 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.54 
 
 		 626 aa  347  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.22 
 
 		 607 aa  346  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.54 
 
 		 626 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.72 
 
 		 615 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.21 
 
 		 608 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.12 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.66 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.6 
 
 		 606 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.3 
 
 		 591 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  34.6 
 
 		 606 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.06 
 
 		 627 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.02 
 
 		 625 aa  339  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.9 
 
 		 592 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.91 
 
 		 620 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.93 
 
 		 588 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.6 
 
 		 606 aa  333  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.72 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  34.78 
 
 		 578 aa  329  8e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.36 
 
 		 638 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.48 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.51 
 
 		 590 aa  320  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  33.68 
 
 		 611 aa  316  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.7 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  30.19 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  30.45 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.03 
 
 		 597 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  29.1 
 
 		 594 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.82 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  27.61 
 
 		 619 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  29.03 
 
 		 596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  27.91 
 
 		 618 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  27.26 
 
 		 592 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  27.44 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.23 
 
 		 603 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  27.27 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  27.32 
 
 		 604 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  27.38 
 
 		 600 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  27.58 
 
 		 590 aa  177  5e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  27.36 
 
 		 598 aa  176  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.21 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  26.35 
 
 		 597 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  27.9 
 
 		 602 aa  173  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  27.9 
 
 		 602 aa  173  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.92 
 
 		 609 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  26.17 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  27.44 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.87 
 
 		 597 aa  171  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.72 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  28.67 
 
 		 606 aa  171  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.5 
 
 		 600 aa  171  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  28.66 
 
 		 599 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1306  oligoendopeptidase F  26.22 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  29.62 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  26.04 
 
 		 603 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  26.7 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  26.7 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  27.05 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  28.59 
 
 		 599 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.44 
 
 		 622 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  24.59 
 
 		 654 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  26.53 
 
 		 608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  26.29 
 
 		 587 aa  164  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>