237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2169 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 601 aa  1237    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  38.79 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.27 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.46 
 
 		 625 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  39.93 
 
 		 597 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  38.24 
 
 		 664 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.13 
 
 		 625 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  38.09 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.08 
 
 		 634 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.1 
 
 		 620 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  38.14 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.13 
 
 		 601 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.12 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.74 
 
 		 623 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.27 
 
 		 627 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.38 
 
 		 617 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.6 
 
 		 616 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  38.1 
 
 		 626 aa  364  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  38.13 
 
 		 620 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  38.13 
 
 		 620 aa  364  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.79 
 
 		 620 aa  364  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  37.88 
 
 		 625 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.25 
 
 		 620 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.9 
 
 		 638 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  37.71 
 
 		 619 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  37.29 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.19 
 
 		 617 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.46 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.5 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  37.42 
 
 		 611 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37 
 
 		 622 aa  343  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.47 
 
 		 607 aa  343  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.25 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.97 
 
 		 606 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.81 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  36.75 
 
 		 606 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.03 
 
 		 606 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.95 
 
 		 589 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.24 
 
 		 608 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.88 
 
 		 601 aa  296  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.82 
 
 		 589 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  35.56 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.78 
 
 		 612 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  35 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.49 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.78 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.29 
 
 		 591 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.51 
 
 		 592 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.33 
 
 		 573 aa  263  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  29.78 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.66 
 
 		 607 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  30.02 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.83 
 
 		 603 aa  247  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  29.25 
 
 		 573 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  29.41 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  29.39 
 
 		 571 aa  241  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  30.19 
 
 		 573 aa  239  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.98 
 
 		 578 aa  228  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.76 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  26.92 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.29 
 
 		 590 aa  193  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  26.06 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.66 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.27 
 
 		 597 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.94 
 
 		 619 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.42 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  25.79 
 
 		 595 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.17 
 
 		 600 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  28.6 
 
 		 609 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.16 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  26.45 
 
 		 596 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  25.4 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  26.34 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.9 
 
 		 594 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  26.33 
 
 		 598 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.84 
 
 		 584 aa  146  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  28.4 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  24.75 
 
 		 598 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  25.21 
 
 		 602 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  25.57 
 
 		 601 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  25.47 
 
 		 608 aa  139  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  28.52 
 
 		 644 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  26.42 
 
 		 603 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.94 
 
 		 622 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  25.37 
 
 		 601 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  27.59 
 
 		 587 aa  136  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  25.08 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  24.62 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.07 
 
 		 582 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  27.48 
 
 		 602 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  25.17 
 
 		 593 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  27.15 
 
 		 608 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  25.13 
 
 		 603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  26.12 
 
 		 602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  26.12 
 
 		 602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  26.8 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.57 
 
 		 612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.58 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>