236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2730 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  64.36 
 
 
614 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  68.15 
 
 
620 aa  860    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  66.61 
 
 
623 aa  816    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  74.83 
 
 
620 aa  963    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  67.33 
 
 
616 aa  842    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  66.78 
 
 
601 aa  821    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  65.51 
 
 
616 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  66.83 
 
 
625 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  59.5 
 
 
606 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  66.11 
 
 
625 aa  832    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  56.52 
 
 
597 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  68.37 
 
 
610 aa  847    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  57.57 
 
 
607 aa  711    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  66.61 
 
 
626 aa  847    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  68.2 
 
 
632 aa  840    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  66.18 
 
 
626 aa  843    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  57.86 
 
 
606 aa  695    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 
616 aa  1267    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  70.12 
 
 
634 aa  865    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  71.62 
 
 
617 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  68.66 
 
 
619 aa  890    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  65.95 
 
 
625 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  68.54 
 
 
638 aa  831    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  59.47 
 
 
620 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  59.67 
 
 
606 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  59.83 
 
 
606 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  58.21 
 
 
615 aa  691    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  57.31 
 
 
611 aa  710    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  67.79 
 
 
664 aa  854    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  58.09 
 
 
615 aa  697    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  68.58 
 
 
622 aa  865    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  74.83 
 
 
620 aa  964    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  71.79 
 
 
617 aa  915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  71.81 
 
 
627 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  74.23 
 
 
620 aa  977    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.99 
 
 
608 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.91 
 
 
589 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.56 
 
 
601 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.05 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  41.88 
 
 
598 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  41.88 
 
 
598 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.26 
 
 
573 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  36.97 
 
 
569 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  36.33 
 
 
571 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  36.08 
 
 
573 aa  364  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  37.02 
 
 
596 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.71 
 
 
588 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.37 
 
 
588 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  34.24 
 
 
573 aa  359  6e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.41 
 
 
589 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  38.1 
 
 
612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  34.4 
 
 
573 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  34.63 
 
 
566 aa  355  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  34.41 
 
 
572 aa  353  4e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  37.46 
 
 
601 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.59 
 
 
591 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  34.19 
 
 
573 aa  350  4e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.59 
 
 
592 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  35.97 
 
 
577 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.52 
 
 
603 aa  323  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.59 
 
 
578 aa  272  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.21 
 
 
584 aa  270  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.54 
 
 
590 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.62 
 
 
597 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.35 
 
 
586 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.48 
 
 
584 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 
596 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.1 
 
 
582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.43 
 
 
598 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  30.15 
 
 
587 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  27.88 
 
 
609 aa  193  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.12 
 
 
597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.93 
 
 
603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.31 
 
 
619 aa  184  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.57 
 
 
593 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.77 
 
 
600 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  27.43 
 
 
595 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  25.41 
 
 
598 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.38 
 
 
603 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  26.87 
 
 
644 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  26.22 
 
 
599 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  24.71 
 
 
599 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.94 
 
 
597 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  27.46 
 
 
600 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  27.17 
 
 
602 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  26.73 
 
 
646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.03 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.95 
 
 
606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  26.37 
 
 
595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  25.97 
 
 
594 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  26.54 
 
 
604 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  26.4 
 
 
649 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  25.91 
 
 
599 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  25.99 
 
 
595 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.12 
 
 
607 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  25.75 
 
 
595 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  26.24 
 
 
654 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  27.02 
 
 
603 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.57 
 
 
612 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  25.58 
 
 
595 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>