269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1896 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  100 
 
 		 601 aa  1217    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  55.01 
 
 		 589 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  52.81 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  52.81 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  50.96 
 
 		 607 aa  552  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.17 
 
 		 622 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.76 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.75 
 
 		 620 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.5 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.7 
 
 		 616 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.17 
 
 		 625 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  47.36 
 
 		 616 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.84 
 
 		 601 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.44 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.76 
 
 		 620 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.62 
 
 		 616 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.81 
 
 		 614 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.5 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  43.25 
 
 		 620 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  43.22 
 
 		 597 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  43.25 
 
 		 620 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  43.1 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  40.03 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  39.23 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  39.13 
 
 		 569 aa  455  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.97 
 
 		 615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  39.44 
 
 		 573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  42.83 
 
 		 619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.64 
 
 		 615 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.56 
 
 		 617 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.83 
 
 		 612 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  43.4 
 
 		 664 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  39.93 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  40.1 
 
 		 573 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.22 
 
 		 617 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.86 
 
 		 627 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  43.34 
 
 		 626 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  43.08 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  43 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  39.76 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.98 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.03 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  42.49 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.69 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  43.2 
 
 		 606 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.86 
 
 		 606 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.83 
 
 		 638 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  40.62 
 
 		 607 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  40.64 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.37 
 
 		 606 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.46 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.57 
 
 		 588 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.66 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.7 
 
 		 591 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.03 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  35.78 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.95 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35.07 
 
 		 584 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.15 
 
 		 608 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.05 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  37.44 
 
 		 601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.18 
 
 		 590 aa  297  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  34.72 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.85 
 
 		 597 aa  259  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  30 
 
 		 596 aa  250  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.82 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  33.8 
 
 		 600 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  33.5 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  30.85 
 
 		 608 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  31.2 
 
 		 609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  32.03 
 
 		 607 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  30.68 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  28.81 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.75 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  28.67 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  30.34 
 
 		 608 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  30.34 
 
 		 608 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  30.55 
 
 		 608 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  29.15 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  30 
 
 		 608 aa  218  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  29.9 
 
 		 599 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.99 
 
 		 599 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  30.2 
 
 		 608 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  30.38 
 
 		 608 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  26.66 
 
 		 599 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.42 
 
 		 594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  31.91 
 
 		 602 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 597 aa  212  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  28.6 
 
 		 619 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  28.41 
 
 		 601 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  27.81 
 
 		 622 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  28.11 
 
 		 597 aa  206  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  28.62 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  29.32 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  26.32 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  29.32 
 
 		 601 aa  200  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>