228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2068 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  100 
 
 
603 aa  1235    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.5 
 
 
612 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  41.85 
 
 
596 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.22 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.34 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.24 
 
 
588 aa  445  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.35 
 
 
592 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.71 
 
 
589 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.18 
 
 
589 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.93 
 
 
601 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.01 
 
 
573 aa  356  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.57 
 
 
607 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  35.54 
 
 
620 aa  346  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.39 
 
 
584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.93 
 
 
620 aa  343  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  35.2 
 
 
620 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.39 
 
 
616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.54 
 
 
623 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.09 
 
 
620 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.12 
 
 
615 aa  329  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.96 
 
 
614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  35.83 
 
 
598 aa  326  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35.83 
 
 
598 aa  326  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.62 
 
 
625 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.05 
 
 
616 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.69 
 
 
625 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.58 
 
 
622 aa  324  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  34.48 
 
 
573 aa  324  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  34.97 
 
 
664 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.2 
 
 
601 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.52 
 
 
626 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.96 
 
 
617 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.41 
 
 
625 aa  320  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.27 
 
 
606 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.25 
 
 
597 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.96 
 
 
617 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.52 
 
 
616 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.65 
 
 
615 aa  317  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.21 
 
 
620 aa  316  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  33.45 
 
 
610 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  33.9 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.96 
 
 
597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  32.86 
 
 
573 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.16 
 
 
634 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.65 
 
 
590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  32.94 
 
 
632 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.9 
 
 
627 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  32.82 
 
 
569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  33.45 
 
 
626 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.93 
 
 
606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  34.76 
 
 
606 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  31.85 
 
 
573 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  32.54 
 
 
572 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  32.99 
 
 
619 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  31.86 
 
 
573 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.28 
 
 
638 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.48 
 
 
607 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  33.33 
 
 
611 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.39 
 
 
606 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.52 
 
 
578 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  30.73 
 
 
566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  32.83 
 
 
601 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  29.66 
 
 
598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.05 
 
 
608 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  29.4 
 
 
592 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  30.02 
 
 
601 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  30.3 
 
 
597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  31.7 
 
 
607 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.14 
 
 
586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  30.55 
 
 
599 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.77 
 
 
603 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  29.81 
 
 
600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.36 
 
 
612 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  29.88 
 
 
604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.77 
 
 
593 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  30.13 
 
 
596 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.2 
 
 
582 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  29.17 
 
 
601 aa  213  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  29.12 
 
 
601 aa  213  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  28.26 
 
 
577 aa  211  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  30.63 
 
 
608 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.35 
 
 
600 aa  210  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  30.46 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  30.12 
 
 
608 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.36 
 
 
603 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  29.26 
 
 
601 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  29.9 
 
 
602 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  30.29 
 
 
608 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  29.12 
 
 
605 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  28.84 
 
 
604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  27.93 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  28.25 
 
 
608 aa  201  3e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  30.67 
 
 
599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>