253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1993 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  59.22 
 
 
596 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  55.86 
 
 
588 aa  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  100 
 
 
592 aa  1227    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  61.5 
 
 
612 aa  757    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  55.35 
 
 
588 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  78.17 
 
 
589 aa  965    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  58.26 
 
 
591 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.35 
 
 
603 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.94 
 
 
589 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.38 
 
 
601 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  35.84 
 
 
598 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35.84 
 
 
598 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.52 
 
 
573 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.62 
 
 
584 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.82 
 
 
607 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.28 
 
 
578 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.39 
 
 
597 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  36.78 
 
 
620 aa  369  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.16 
 
 
620 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  36.1 
 
 
620 aa  365  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.55 
 
 
614 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.44 
 
 
620 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.71 
 
 
615 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.41 
 
 
634 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  35.16 
 
 
573 aa  348  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.56 
 
 
590 aa  345  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  35.63 
 
 
573 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.97 
 
 
622 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.59 
 
 
616 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.75 
 
 
610 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.64 
 
 
617 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  34.4 
 
 
664 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.69 
 
 
617 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.67 
 
 
620 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.77 
 
 
626 aa  340  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.15 
 
 
606 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.07 
 
 
615 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  35.63 
 
 
572 aa  339  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  34.81 
 
 
569 aa  339  8e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  33.9 
 
 
573 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  34.7 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  35.1 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.86 
 
 
627 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.41 
 
 
632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.58 
 
 
616 aa  336  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.58 
 
 
638 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  34.34 
 
 
619 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.41 
 
 
601 aa  333  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.46 
 
 
625 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  34.92 
 
 
606 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.9 
 
 
625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.75 
 
 
606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.73 
 
 
625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  33.9 
 
 
626 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  34.35 
 
 
611 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.39 
 
 
623 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.9 
 
 
616 aa  317  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.57 
 
 
597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.28 
 
 
606 aa  293  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33 
 
 
608 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  31.01 
 
 
607 aa  289  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  32.31 
 
 
566 aa  288  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  32.51 
 
 
601 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.97 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  27.75 
 
 
600 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.63 
 
 
586 aa  210  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  28.33 
 
 
605 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.5 
 
 
603 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.35 
 
 
603 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.47 
 
 
594 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  29.04 
 
 
599 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  27.23 
 
 
608 aa  195  2e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.29 
 
 
582 aa  193  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  25.89 
 
 
592 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  27.64 
 
 
606 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  27.54 
 
 
644 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.29 
 
 
593 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.86 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  27.38 
 
 
646 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 
596 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  27 
 
 
597 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  27.26 
 
 
649 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  27.26 
 
 
654 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  26.52 
 
 
602 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  26.44 
 
 
601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  25.84 
 
 
599 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  27.68 
 
 
595 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  26.71 
 
 
601 aa  183  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  25.42 
 
 
603 aa  182  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  27.16 
 
 
608 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  27.16 
 
 
608 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  27.12 
 
 
608 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  27.16 
 
 
608 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  27.12 
 
 
608 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  27.16 
 
 
608 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  26.1 
 
 
599 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  24.5 
 
 
603 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  26.27 
 
 
608 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  26.98 
 
 
608 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  26.98 
 
 
608 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>