256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1817 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 
597 aa  1239    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.64 
 
 
590 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.69 
 
 
612 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.05 
 
 
591 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.31 
 
 
588 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.99 
 
 
589 aa  317  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.86 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.57 
 
 
592 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.96 
 
 
603 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.31 
 
 
584 aa  313  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  30.44 
 
 
596 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.66 
 
 
589 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.94 
 
 
578 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.48 
 
 
617 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.45 
 
 
601 aa  250  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.21 
 
 
620 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.33 
 
 
614 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  27.73 
 
 
620 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  27.73 
 
 
620 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.62 
 
 
616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.89 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.87 
 
 
607 aa  243  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.51 
 
 
615 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.74 
 
 
617 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.94 
 
 
632 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.77 
 
 
606 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.27 
 
 
606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.11 
 
 
598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.35 
 
 
634 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  28.11 
 
 
598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  27.64 
 
 
619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  27.1 
 
 
606 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.25 
 
 
610 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  28.2 
 
 
664 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  29.04 
 
 
597 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.69 
 
 
627 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.44 
 
 
620 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.24 
 
 
620 aa  227  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.81 
 
 
616 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.03 
 
 
607 aa  225  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.89 
 
 
626 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  28.13 
 
 
611 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.72 
 
 
625 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  27.03 
 
 
573 aa  219  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.59 
 
 
606 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.45 
 
 
626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.64 
 
 
625 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  26.96 
 
 
569 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.71 
 
 
601 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.64 
 
 
625 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.56 
 
 
638 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.15 
 
 
622 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27 
 
 
573 aa  210  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.52 
 
 
623 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.51 
 
 
616 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  26.95 
 
 
573 aa  207  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  26.15 
 
 
571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  27.09 
 
 
566 aa  193  7e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  25.23 
 
 
572 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  24.5 
 
 
573 aa  183  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  26.39 
 
 
600 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  24.86 
 
 
573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 
596 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  25.43 
 
 
600 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  23.39 
 
 
597 aa  177  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  26.62 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  26.12 
 
 
646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  26.44 
 
 
649 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.88 
 
 
608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.41 
 
 
622 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  28.27 
 
 
601 aa  170  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  25.57 
 
 
619 aa  169  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  24.02 
 
 
599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  24.53 
 
 
602 aa  165  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  26.43 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  26.43 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  23.84 
 
 
599 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  26.09 
 
 
608 aa  163  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  25.08 
 
 
597 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  25.45 
 
 
577 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  22.9 
 
 
594 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  26.26 
 
 
608 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  26.26 
 
 
608 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.55 
 
 
603 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  26.26 
 
 
608 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  25.59 
 
 
608 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  25.65 
 
 
607 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  24.54 
 
 
604 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.26 
 
 
603 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  25.93 
 
 
608 aa  160  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  25.42 
 
 
608 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  25.71 
 
 
608 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  23.17 
 
 
595 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  27.27 
 
 
605 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  25 
 
 
602 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  25 
 
 
602 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3095  oligoendopeptidase F  25.18 
 
 
618 aa  156  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  25.91 
 
 
609 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.4 
 
 
582 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  23.29 
 
 
603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>