251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2001 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  100 
 
 		 597 aa  1226    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.18 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.73 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  39.09 
 
 		 587 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.33 
 
 		 584 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.35 
 
 		 603 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35.76 
 
 		 606 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.86 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.89 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.92 
 
 		 598 aa  273  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  29.28 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  30.45 
 
 		 599 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  29.62 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  28.81 
 
 		 600 aa  259  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.7 
 
 		 607 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  28.38 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  29.59 
 
 		 593 aa  248  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.3 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.65 
 
 		 590 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  29.82 
 
 		 612 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.07 
 
 		 588 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.15 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.17 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  26.88 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  26.21 
 
 		 632 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 		 620 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  27.36 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  26.48 
 
 		 664 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  27.79 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.83 
 
 		 625 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.05 
 
 		 617 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  26.33 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.73 
 
 		 622 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  29.37 
 
 		 573 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.67 
 
 		 625 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.23 
 
 		 607 aa  194  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.85 
 
 		 608 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  26.5 
 
 		 610 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.38 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.91 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.21 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.48 
 
 		 617 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.35 
 
 		 620 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.83 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.87 
 
 		 625 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.94 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 573 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.62 
 
 		 601 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.83 
 
 		 616 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.85 
 
 		 616 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.85 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.25 
 
 		 634 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.69 
 
 		 627 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.12 
 
 		 614 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.77 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.21 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.16 
 
 		 623 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.51 
 
 		 578 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.96 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  26.81 
 
 		 573 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.3 
 
 		 606 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.38 
 
 		 589 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.08 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.17 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.07 
 
 		 600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.17 
 
 		 606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  25.83 
 
 		 606 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25 
 
 		 592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  27.08 
 
 		 527 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25 
 
 		 597 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.58 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.83 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  29.71 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  26.68 
 
 		 596 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  26.92 
 
 		 566 aa  160  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  27.21 
 
 		 569 aa  160  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.22 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  25.81 
 
 		 598 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  27.21 
 
 		 571 aa  159  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.81 
 
 		 598 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.9 
 
 		 594 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  28.22 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  28.22 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  26.5 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  25.38 
 
 		 611 aa  157  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  29.41 
 
 		 527 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.71 
 
 		 577 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.94 
 
 		 598 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  29.12 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  28.53 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  28.1 
 
 		 600 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.68 
 
 		 615 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  27.05 
 
 		 599 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.26 
 
 		 619 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.3 
 
 		 599 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  25.74 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  24.88 
 
 		 604 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>