237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0719 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  54.85 
 
 		 573 aa  636    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  64.73 
 
 		 573 aa  776    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  58.17 
 
 		 573 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  65.43 
 
 		 571 aa  780    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  58.63 
 
 		 566 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  100 
 
 		 569 aa  1164    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  58.88 
 
 		 572 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  58.55 
 
 		 573 aa  699    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  58.52 
 
 		 573 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.27 
 
 		 601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.06 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  37.89 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  37.89 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.07 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.07 
 
 		 625 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.07 
 
 		 625 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.91 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.9 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.88 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.33 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  35.27 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.79 
 
 		 620 aa  379  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.97 
 
 		 616 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.18 
 
 		 620 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.62 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  35.78 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  35.6 
 
 		 620 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.27 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  35.18 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.27 
 
 		 617 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.47 
 
 		 627 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.14 
 
 		 634 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.32 
 
 		 620 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.56 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.08 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.95 
 
 		 607 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  35.43 
 
 		 664 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.45 
 
 		 589 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.59 
 
 		 607 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  33.96 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.23 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  35.06 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35 
 
 		 606 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  34.18 
 
 		 626 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  33.96 
 
 		 632 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  35.34 
 
 		 606 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  34.24 
 
 		 596 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.67 
 
 		 626 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.81 
 
 		 592 aa  339  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  35.17 
 
 		 612 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.51 
 
 		 638 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.27 
 
 		 608 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.94 
 
 		 588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  32.99 
 
 		 625 aa  329  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  32.87 
 
 		 611 aa  329  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.76 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.59 
 
 		 591 aa  316  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.82 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.01 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.6 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.53 
 
 		 584 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  30.02 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  30.32 
 
 		 577 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.96 
 
 		 597 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  29.31 
 
 		 594 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  30.05 
 
 		 590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  28.94 
 
 		 606 aa  194  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.67 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  28.4 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  30.71 
 
 		 596 aa  187  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  27.53 
 
 		 598 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  28.62 
 
 		 608 aa  186  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  27.29 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  28.79 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  28.35 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  28.35 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  27.7 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  26.92 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.54 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  26.49 
 
 		 618 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  27.14 
 
 		 592 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  27.08 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  27.89 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  27.02 
 
 		 600 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 		 608 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 		 608 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  28.47 
 
 		 608 aa  177  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  27.17 
 
 		 629 aa  176  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  27.78 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  27.78 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  27.85 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  27.78 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  27.39 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  26.13 
 
 		 603 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  27.68 
 
 		 608 aa  174  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  25.75 
 
 		 603 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.46 
 
 		 603 aa  173  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>