260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0701 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  77.07 
 
 		 573 aa  920    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  56.92 
 
 		 573 aa  661    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  58.73 
 
 		 573 aa  691    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  100 
 
 		 571 aa  1179    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  55.11 
 
 		 573 aa  659    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  65.43 
 
 		 569 aa  780    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  57.62 
 
 		 573 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  57.27 
 
 		 572 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  58.05 
 
 		 566 aa  641    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  40.11 
 
 		 601 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  39.41 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  39.41 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.73 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.05 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.61 
 
 		 620 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.07 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.65 
 
 		 601 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.48 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.8 
 
 		 625 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.66 
 
 		 620 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.14 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.48 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  38.06 
 
 		 619 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.33 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  35.67 
 
 		 664 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.75 
 
 		 634 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.31 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  35.54 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  35.87 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  36.73 
 
 		 620 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  36.56 
 
 		 620 aa  362  9e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  35.15 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.01 
 
 		 620 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.96 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.17 
 
 		 617 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.21 
 
 		 617 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.47 
 
 		 626 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.61 
 
 		 607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.96 
 
 		 627 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.27 
 
 		 606 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.9 
 
 		 625 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  35.27 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.91 
 
 		 597 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.99 
 
 		 614 aa  349  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.52 
 
 		 638 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  35.03 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  35.38 
 
 		 606 aa  343  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  33.33 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.93 
 
 		 615 aa  342  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.69 
 
 		 612 aa  342  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.11 
 
 		 608 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.7 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.97 
 
 		 589 aa  333  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.44 
 
 		 591 aa  331  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.68 
 
 		 588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.68 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  33.28 
 
 		 611 aa  320  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.9 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.79 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.42 
 
 		 578 aa  277  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.58 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  29.39 
 
 		 601 aa  241  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.96 
 
 		 577 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.49 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.15 
 
 		 597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.18 
 
 		 586 aa  193  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  30.21 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  27.99 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  25.93 
 
 		 618 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  28.57 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  26.87 
 
 		 604 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  27.07 
 
 		 592 aa  177  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  26.68 
 
 		 600 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  29.08 
 
 		 619 aa  176  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  26.47 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  27.99 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  29.47 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.71 
 
 		 603 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.55 
 
 		 603 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  26.78 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  27.45 
 
 		 601 aa  170  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  26.25 
 
 		 599 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.06 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  26.94 
 
 		 608 aa  169  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  25.63 
 
 		 608 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  25.63 
 
 		 608 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  26.81 
 
 		 606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  28.5 
 
 		 601 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  27.01 
 
 		 605 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  25.46 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  25.46 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  25.46 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  25.29 
 
 		 608 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  26.69 
 
 		 622 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  25.29 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  25.29 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  25.5 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  24.79 
 
 		 597 aa  164  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  31.28 
 
 		 602 aa  163  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>