247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0534 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 
577 aa  1199    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  52.19 
 
 
571 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  51.87 
 
 
577 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  51.85 
 
 
580 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  49.38 
 
 
566 aa  606  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  48.84 
 
 
572 aa  597  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  42.76 
 
 
569 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  40.55 
 
 
548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  40 
 
 
548 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  39.74 
 
 
563 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  39.28 
 
 
563 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  39.47 
 
 
563 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  37.61 
 
 
563 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  38.9 
 
 
563 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  37.85 
 
 
563 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  36.95 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  36.95 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  37.66 
 
 
563 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  37.66 
 
 
563 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  39.18 
 
 
561 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  35.79 
 
 
570 aa  333  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  44.41 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  31.12 
 
 
578 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  29.63 
 
 
548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  29.26 
 
 
548 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  29.26 
 
 
548 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  29.07 
 
 
548 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  29.05 
 
 
565 aa  249  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  29.07 
 
 
548 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  29.1 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  29.02 
 
 
564 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  28.89 
 
 
548 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  29.19 
 
 
564 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  30.28 
 
 
567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  29.51 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  30.2 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  28.19 
 
 
564 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  28.4 
 
 
564 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  27.94 
 
 
564 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  29.48 
 
 
554 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  27.76 
 
 
564 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  27.76 
 
 
564 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  27.76 
 
 
564 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  27.76 
 
 
564 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  28.04 
 
 
564 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  27.58 
 
 
564 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  27.58 
 
 
564 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  27.4 
 
 
564 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  28.81 
 
 
565 aa  224  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  27.07 
 
 
576 aa  220  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  27.91 
 
 
564 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  28.24 
 
 
555 aa  197  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  31.82 
 
 
297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 
602 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 
602 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  25.53 
 
 
609 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.33 
 
 
622 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  25.92 
 
 
622 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.35 
 
 
573 aa  92.8  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  22.35 
 
 
619 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0580  oligoendopeptidase F  26.13 
 
 
602 aa  92  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.970451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.19 
 
 
627 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  29.33 
 
 
233 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  23.38 
 
 
593 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  22.32 
 
 
595 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  27 
 
 
573 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  26.09 
 
 
573 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  20.42 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.35 
 
 
578 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  22.32 
 
 
595 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.84 
 
 
625 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.27 
 
 
625 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.72 
 
 
606 aa  87.8  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  26.17 
 
 
573 aa  87.8  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.76 
 
 
616 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.04 
 
 
634 aa  87.4  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.61 
 
 
590 aa  87  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  28 
 
 
599 aa  87  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.45 
 
 
601 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  26.67 
 
 
602 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  22.32 
 
 
595 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  26.11 
 
 
606 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.17 
 
 
616 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  21.93 
 
 
595 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  22.55 
 
 
595 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.48 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  21.96 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  28.62 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  21.96 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  28.31 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.11 
 
 
607 aa  85.9  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.89 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  21.25 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  21.78 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  20.79 
 
 
597 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.4 
 
 
617 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  21.67 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.17 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.45 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  21.96 
 
 
595 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>