175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1755 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  56.23 
 
 
576 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  67.2 
 
 
564 aa  820    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  67.2 
 
 
564 aa  819    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  67.2 
 
 
564 aa  819    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  66.84 
 
 
564 aa  816    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  67.2 
 
 
564 aa  819    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  79.43 
 
 
564 aa  970    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  57.22 
 
 
564 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  56.86 
 
 
564 aa  701    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  67.2 
 
 
564 aa  819    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  61.57 
 
 
564 aa  741    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  66.67 
 
 
564 aa  816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  67.02 
 
 
564 aa  816    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  66.84 
 
 
564 aa  815    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  67.02 
 
 
564 aa  818    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  67.73 
 
 
564 aa  823    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 
564 aa  1177    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  51.5 
 
 
565 aa  621  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  51.42 
 
 
567 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  43.26 
 
 
565 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  44.98 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  41.8 
 
 
555 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  29.19 
 
 
577 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  32.48 
 
 
569 aa  226  9e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  29.25 
 
 
577 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  30.63 
 
 
548 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  25.64 
 
 
563 aa  216  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  27.25 
 
 
571 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  29.5 
 
 
580 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  26.64 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  26.69 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  26.44 
 
 
563 aa  213  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  26.92 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  26.92 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  27.92 
 
 
572 aa  213  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  27.13 
 
 
566 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  27 
 
 
563 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  26.3 
 
 
563 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  26.68 
 
 
563 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  28.07 
 
 
548 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  26.05 
 
 
563 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.87 
 
 
561 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  29.8 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  28.26 
 
 
305 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  27.93 
 
 
548 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  27.93 
 
 
548 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  26.88 
 
 
548 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  25.65 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  26.63 
 
 
548 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  26.82 
 
 
548 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  26.53 
 
 
548 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  22.57 
 
 
578 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  23.8 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  21.96 
 
 
664 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.67 
 
 
601 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  21.31 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  20.41 
 
 
584 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.19 
 
 
622 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.9 
 
 
582 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.78 
 
 
601 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  26.42 
 
 
297 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.92 
 
 
625 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  29.37 
 
 
599 aa  63.9  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  29.37 
 
 
598 aa  63.9  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.92 
 
 
625 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  23.27 
 
 
577 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  20.91 
 
 
620 aa  62.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  27.5 
 
 
233 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.25 
 
 
625 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.38 
 
 
588 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  21.16 
 
 
632 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  26.09 
 
 
527 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.89 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.78 
 
 
590 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  23.79 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.79 
 
 
593 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  22.25 
 
 
618 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  23.08 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  19.11 
 
 
597 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  21.78 
 
 
606 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1446  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.19 
 
 
610 aa  57.4  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  24.51 
 
 
527 aa  57.4  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  23.84 
 
 
527 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  22.12 
 
 
590 aa  56.6  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.15 
 
 
607 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.32 
 
 
615 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.1 
 
 
588 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  24.51 
 
 
527 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.74 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  22.22 
 
 
600 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.04 
 
 
584 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.88 
 
 
638 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  26.67 
 
 
596 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  25.42 
 
 
587 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  24.51 
 
 
527 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  26.01 
 
 
600 aa  54.7  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.03 
 
 
615 aa  54.7  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.98 
 
 
623 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  22.48 
 
 
593 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.32 
 
 
607 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>