216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2738 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  100 
 
 
576 aa  1202    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  56.38 
 
 
564 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  56.38 
 
 
564 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  56.23 
 
 
564 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  56.38 
 
 
564 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  56.21 
 
 
564 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  56.21 
 
 
564 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  56.38 
 
 
564 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  53.9 
 
 
564 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  53.55 
 
 
564 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  56.21 
 
 
564 aa  694    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  53.56 
 
 
564 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  56.03 
 
 
564 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  56.38 
 
 
564 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  56.03 
 
 
564 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  57.47 
 
 
564 aa  704    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  55.85 
 
 
564 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  55.06 
 
 
565 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  46.96 
 
 
567 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  42.7 
 
 
565 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  42.34 
 
 
554 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  37.05 
 
 
555 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  30.74 
 
 
569 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  28.98 
 
 
580 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  27.07 
 
 
577 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  30.72 
 
 
548 aa  220  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.26 
 
 
561 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  27.9 
 
 
563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  28.12 
 
 
572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  27.48 
 
 
563 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  27.68 
 
 
563 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  28.94 
 
 
548 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  27.2 
 
 
563 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  27.2 
 
 
563 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  27.23 
 
 
563 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  26.79 
 
 
577 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  27.29 
 
 
563 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  27.35 
 
 
563 aa  203  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  26.13 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  27.59 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  27.39 
 
 
563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  27.73 
 
 
566 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  27.45 
 
 
570 aa  174  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  32.39 
 
 
305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  26.5 
 
 
548 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  25 
 
 
578 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  27.08 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  27.08 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  26.12 
 
 
548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  24.71 
 
 
548 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  24.94 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  24.66 
 
 
548 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.06 
 
 
601 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  24.03 
 
 
622 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.19 
 
 
573 aa  79  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.47 
 
 
616 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.11 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.46 
 
 
578 aa  77  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.49 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.28 
 
 
601 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.14 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.41 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.47 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1648  oligoendopeptidase F  23.04 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  24.64 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  23.26 
 
 
619 aa  73.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.09 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  25.67 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  22.06 
 
 
599 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  24.85 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.91 
 
 
625 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  23.27 
 
 
603 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  23.46 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  23.33 
 
 
620 aa  69.3  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  22.44 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.43 
 
 
591 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  23.38 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  23.33 
 
 
620 aa  68.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  23.5 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  23.49 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  27.94 
 
 
592 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  21.74 
 
 
598 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  22.66 
 
 
604 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  21.9 
 
 
596 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  24.81 
 
 
595 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.78 
 
 
620 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  22.5 
 
 
571 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  24.32 
 
 
590 aa  66.2  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  23.41 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  23.1 
 
 
606 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.24 
 
 
603 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  25.06 
 
 
595 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
595 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.74 
 
 
623 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.41 
 
 
622 aa  65.1  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.32 
 
 
592 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  22.94 
 
 
632 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  22.77 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>