229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1565 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  55.06 
 
 		 577 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  56.84 
 
 		 580 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  100 
 
 		 566 aa  1181    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  51.95 
 
 		 571 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  49.38 
 
 		 577 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  49.19 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  42.31 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  42.13 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  38.85 
 
 		 569 aa  415  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  38.52 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  38.84 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  37.71 
 
 		 563 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  38.65 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  39.02 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  38.7 
 
 		 563 aa  389  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  38.65 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  38.7 
 
 		 563 aa  389  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  39.21 
 
 		 563 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  39.02 
 
 		 563 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.61 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  31.43 
 
 		 570 aa  307  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  44.07 
 
 		 305 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  29.62 
 
 		 548 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  29.19 
 
 		 578 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  29.78 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  29.78 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  29.98 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  29.62 
 
 		 548 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  29.09 
 
 		 548 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  29.24 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  28.44 
 
 		 565 aa  229  9e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  27.77 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  27.06 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  27.13 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  27.87 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  27.67 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  26.9 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  26.52 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  26.33 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  26.65 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  26.65 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  26.65 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  26.6 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  26.65 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  26.93 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  26.13 
 
 		 564 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  26.45 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  27.73 
 
 		 576 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  26.69 
 
 		 564 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  26.77 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  26.1 
 
 		 564 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  25.15 
 
 		 564 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  30.94 
 
 		 297 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  31.1 
 
 		 233 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.32 
 
 		 609 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  24.94 
 
 		 595 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.76 
 
 		 591 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  24.39 
 
 		 593 aa  87.4  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  24.46 
 
 		 595 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  23.9 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  24.5 
 
 		 590 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  24.46 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  24.46 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  24.46 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  24.15 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  23.5 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  23.12 
 
 		 595 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.33 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  22.95 
 
 		 595 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  25.72 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  25.72 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  24.69 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.97 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.27 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.32 
 
 		 592 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.73 
 
 		 625 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3366  oligoendopeptidase F  24.88 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  24.05 
 
 		 600 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  23.08 
 
 		 622 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.82 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  23.86 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.19 
 
 		 622 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.44 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.86 
 
 		 588 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  22.59 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  20.72 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.8 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2201  oligoendopeptidase F  23.74 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110852  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  23.4 
 
 		 573 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  23.64 
 
 		 573 aa  70.5  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  24.6 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.18 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  24.55 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.12 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  21.61 
 
 		 664 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>