206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2318 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  53.55 
 
 
576 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  60.28 
 
 
564 aa  742    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  60.28 
 
 
564 aa  740    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  60.28 
 
 
564 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  60.28 
 
 
564 aa  740    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  60.64 
 
 
564 aa  744    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  56.86 
 
 
564 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  60.11 
 
 
564 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  60.28 
 
 
564 aa  740    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  60.28 
 
 
564 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  61.52 
 
 
564 aa  747    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  99.29 
 
 
564 aa  1161    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 
564 aa  1166    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  59.93 
 
 
564 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  59.57 
 
 
564 aa  734    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  56.38 
 
 
564 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  59.93 
 
 
564 aa  739    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  53.02 
 
 
565 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  45.02 
 
 
567 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  44.83 
 
 
565 aa  497  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  37.5 
 
 
554 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  35.25 
 
 
555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  33.8 
 
 
569 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  29.51 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  28.69 
 
 
563 aa  230  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  28.57 
 
 
571 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  28.22 
 
 
563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  28.25 
 
 
563 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  28.04 
 
 
563 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  27.9 
 
 
580 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  28.04 
 
 
563 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  29.17 
 
 
577 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  31.06 
 
 
548 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  30.18 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  27.54 
 
 
563 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  27.33 
 
 
563 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  27.33 
 
 
563 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  27.05 
 
 
563 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  27.05 
 
 
563 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  27.67 
 
 
566 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  29.81 
 
 
572 aa  201  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.45 
 
 
561 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  26 
 
 
570 aa  180  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  29.6 
 
 
305 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  28.31 
 
 
548 aa  146  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  26.74 
 
 
548 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  26.74 
 
 
548 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  26.99 
 
 
548 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  26.99 
 
 
548 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  26.42 
 
 
548 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  25.94 
 
 
578 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  25.74 
 
 
548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  24.38 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.15 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.47 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  24.23 
 
 
622 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.6 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  22.22 
 
 
620 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  22.22 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  21.51 
 
 
619 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.74 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  22.38 
 
 
664 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.84 
 
 
601 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.95 
 
 
608 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  26.85 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.07 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.84 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.01 
 
 
625 aa  70.1  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.52 
 
 
627 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1648  oligoendopeptidase F  23.27 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  24.65 
 
 
597 aa  67.4  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  21.1 
 
 
599 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.48 
 
 
598 aa  67  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.65 
 
 
588 aa  67  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  22.91 
 
 
598 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  24.22 
 
 
590 aa  66.6  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  20.49 
 
 
578 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  21.3 
 
 
610 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  21.63 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.42 
 
 
612 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.44 
 
 
622 aa  65.1  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  20.64 
 
 
626 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  20.59 
 
 
625 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.34 
 
 
625 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  22.64 
 
 
603 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.34 
 
 
606 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.85 
 
 
597 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  23.38 
 
 
597 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  20.04 
 
 
573 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  21.08 
 
 
606 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  24.36 
 
 
577 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  21.06 
 
 
626 aa  61.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1446  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  21.62 
 
 
610 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  20.34 
 
 
601 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  21.37 
 
 
596 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1092  oligopeptidase F  23.75 
 
 
600 aa  60.8  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.606677  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.37 
 
 
606 aa  60.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  27.42 
 
 
593 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.33 
 
 
614 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.29 
 
 
634 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>