264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5185 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  56.84 
 
 
566 aa  698    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  66.61 
 
 
577 aa  825    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 
580 aa  1202    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  52.54 
 
 
571 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  51.85 
 
 
577 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  49.04 
 
 
572 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  44.36 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  43.92 
 
 
548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  41.59 
 
 
569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  38.6 
 
 
563 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  37.45 
 
 
563 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  37.96 
 
 
563 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  37.77 
 
 
563 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  37.3 
 
 
563 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  37.59 
 
 
563 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  37.59 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  37.3 
 
 
563 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  37.59 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  37.41 
 
 
563 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  38.06 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  35.55 
 
 
570 aa  317  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  42.71 
 
 
305 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  30.51 
 
 
578 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  31.07 
 
 
548 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  30.49 
 
 
548 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  30.49 
 
 
548 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  30.31 
 
 
548 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  30.13 
 
 
548 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  30.13 
 
 
548 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  30.07 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  30.24 
 
 
565 aa  238  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  30.82 
 
 
564 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  34.17 
 
 
554 aa  233  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  28.98 
 
 
576 aa  231  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  28.09 
 
 
564 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  27.9 
 
 
564 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  29.5 
 
 
564 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  27.6 
 
 
564 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  27.01 
 
 
564 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  27.01 
 
 
564 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  27.51 
 
 
564 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  27.4 
 
 
564 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  26.82 
 
 
564 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  26.82 
 
 
564 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  26.82 
 
 
564 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  26.82 
 
 
564 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  26.82 
 
 
564 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  26.61 
 
 
564 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  29.23 
 
 
567 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  32.05 
 
 
555 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  28.74 
 
 
565 aa  199  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  28.15 
 
 
564 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  32.21 
 
 
297 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.82 
 
 
573 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  27.65 
 
 
233 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.02 
 
 
584 aa  92.8  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  27.56 
 
 
609 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.71 
 
 
591 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  22.68 
 
 
593 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  22.52 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.34 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.07 
 
 
625 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  22.52 
 
 
595 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.07 
 
 
625 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  22.97 
 
 
599 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  26.4 
 
 
622 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  23.86 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  23.12 
 
 
595 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  22.93 
 
 
595 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  23.36 
 
 
595 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.96 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.49 
 
 
601 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  23.3 
 
 
595 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  21.54 
 
 
573 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  23.28 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  22.7 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.28 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  22.78 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  22.74 
 
 
595 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  24.75 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  24.75 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  22.04 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  22.54 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  22.54 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.05 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  23.33 
 
 
590 aa  77.8  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  23.35 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  25.08 
 
 
573 aa  77  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2201  oligoendopeptidase F  24.79 
 
 
595 aa  77  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.72 
 
 
622 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  22.49 
 
 
598 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  23.92 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.28 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  25.47 
 
 
618 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.55 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  22.22 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  20.51 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.55 
 
 
588 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  22.33 
 
 
620 aa  73.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.45 
 
 
606 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>