198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3261 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 		 555 aa  1132    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  61.12 
 
 		 554 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  41.8 
 
 		 564 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  39.96 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  39.03 
 
 		 564 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  39.03 
 
 		 564 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  38.95 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  38.95 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  38.95 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  38.95 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  38.59 
 
 		 564 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  38.59 
 
 		 564 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  38.59 
 
 		 564 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  37.05 
 
 		 576 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  38.41 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  37.64 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  35.25 
 
 		 564 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  35.07 
 
 		 564 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  36.98 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  38.13 
 
 		 564 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  40.27 
 
 		 567 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  34.47 
 
 		 565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.18 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  31.73 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  26.74 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  26.9 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  26.67 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  32.05 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  26.9 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  25.67 
 
 		 563 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  29.22 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  26.59 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  23.93 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  23.93 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  24.11 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  28.24 
 
 		 577 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  28.85 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  26.6 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.46 
 
 		 569 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  24.48 
 
 		 563 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  24.48 
 
 		 563 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  25.28 
 
 		 563 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  26.35 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  29.9 
 
 		 305 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  23.54 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  24.37 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  23.86 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  24.11 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  23.77 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  23.77 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  21.49 
 
 		 578 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  22.94 
 
 		 548 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  23.36 
 
 		 622 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  21.43 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  24.41 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  29.01 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.26 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.88 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.6 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.8 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.24 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  24.35 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  23.11 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.49 
 
 		 584 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.02 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  22.65 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  26.56 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.39 
 
 		 590 aa  67  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  27.48 
 
 		 593 aa  67  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  24.49 
 
 		 622 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  23.4 
 
 		 603 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.24 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  20.8 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  22.97 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  26.16 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.56 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.78 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.23 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  22.46 
 
 		 596 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.17 
 
 		 620 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.46 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.65 
 
 		 622 aa  62  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.17 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.9 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  23.61 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  19.18 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  20.43 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.63 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.22 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  21.5 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  23.65 
 
 		 609 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.86 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.19 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  23.01 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.71 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.73 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  21.68 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  22.62 
 
 		 606 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.16 
 
 		 620 aa  57  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.47 
 
 		 612 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>