239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0974 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  52.28 
 
 
577 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  52.54 
 
 
580 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  52.19 
 
 
577 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 
571 aa  1183    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  51.95 
 
 
566 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  44.48 
 
 
572 aa  553  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  40.83 
 
 
548 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  41.48 
 
 
569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  41.02 
 
 
548 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  39.52 
 
 
563 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  39.52 
 
 
563 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  38.76 
 
 
563 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  38.59 
 
 
563 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  38.4 
 
 
563 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  38.78 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  38.78 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  38.78 
 
 
563 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  37.91 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  37.91 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.36 
 
 
561 aa  326  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  33.27 
 
 
548 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  31.56 
 
 
570 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  33.15 
 
 
578 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  33.39 
 
 
548 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  33.39 
 
 
548 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  32.73 
 
 
548 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  33.03 
 
 
548 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  32.91 
 
 
548 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  32.3 
 
 
548 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  43.84 
 
 
305 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  29.17 
 
 
567 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  29.48 
 
 
564 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  28.78 
 
 
564 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  28.57 
 
 
564 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  27.15 
 
 
565 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  27.25 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  26.61 
 
 
564 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  26.97 
 
 
564 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  26.42 
 
 
564 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  26.77 
 
 
564 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  26.57 
 
 
564 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  26.57 
 
 
564 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  26.38 
 
 
564 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  26.38 
 
 
564 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  26.38 
 
 
564 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  26.38 
 
 
564 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  28.17 
 
 
565 aa  206  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  27.7 
 
 
564 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  26.13 
 
 
576 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  25.35 
 
 
554 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  26.57 
 
 
564 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  26.35 
 
 
555 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  35.53 
 
 
297 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  30.77 
 
 
233 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  23.28 
 
 
593 aa  97.4  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.24 
 
 
589 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  25.46 
 
 
622 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  22.08 
 
 
619 aa  94.7  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  23.54 
 
 
602 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  23.54 
 
 
602 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  23.15 
 
 
569 aa  87.8  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  25.26 
 
 
600 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  20.69 
 
 
573 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.55 
 
 
601 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  22.11 
 
 
609 aa  84  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  21.24 
 
 
626 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  22.9 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  20.71 
 
 
620 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.03 
 
 
591 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.05 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  21.82 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  22.54 
 
 
573 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  20.48 
 
 
620 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.25 
 
 
622 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  21.82 
 
 
595 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.19 
 
 
620 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  23 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  21.74 
 
 
610 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.8 
 
 
627 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  22.16 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  22.65 
 
 
595 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.19 
 
 
620 aa  77.8  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  25.06 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  22.65 
 
 
595 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.59 
 
 
578 aa  77  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.34 
 
 
592 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  21.82 
 
 
595 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  21.86 
 
 
612 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.85 
 
 
607 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  21.95 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.43 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  22.3 
 
 
595 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  21.64 
 
 
595 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  20.29 
 
 
625 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  20.19 
 
 
625 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.22 
 
 
597 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.94 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  20 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  25.38 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  21.71 
 
 
664 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>