240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3532 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  52.28 
 
 		 571 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  100 
 
 		 577 aa  1200    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  55.06 
 
 		 566 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  66.61 
 
 		 580 aa  825    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  51.87 
 
 		 577 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  50.8 
 
 		 572 aa  628  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  42.83 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  42.65 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  42.94 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  37.59 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  38.14 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  38.16 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  37.59 
 
 		 563 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  37.59 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  37.78 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  37.78 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  36.97 
 
 		 563 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  36.97 
 
 		 563 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  37.59 
 
 		 563 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.33 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  32.93 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  29.71 
 
 		 548 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  29.71 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  29.71 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  29.35 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  28.99 
 
 		 548 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  42.71 
 
 		 305 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  28.86 
 
 		 578 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  29.92 
 
 		 565 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  29.36 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  28.44 
 
 		 548 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  31.03 
 
 		 564 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  30.08 
 
 		 567 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  28.37 
 
 		 564 aa  223  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  29.22 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  28.32 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  28.32 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  28.32 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  28.32 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  28.06 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  28.32 
 
 		 564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  29.25 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  28.19 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  28.01 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  29.17 
 
 		 564 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  28.99 
 
 		 564 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  28.14 
 
 		 564 aa  210  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  26.79 
 
 		 576 aa  207  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  29.15 
 
 		 554 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  29.22 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  29.25 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  27.54 
 
 		 565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  32.36 
 
 		 297 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  27.67 
 
 		 593 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2594  hypothetical protein  29.35 
 
 		 233 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  24.77 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  25.98 
 
 		 599 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.71 
 
 		 617 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.86 
 
 		 592 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2201  oligoendopeptidase F  23.3 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  24.02 
 
 		 595 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  24.34 
 
 		 595 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  23.79 
 
 		 595 aa  90.5  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  24.44 
 
 		 595 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  24.25 
 
 		 595 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  23.98 
 
 		 595 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.44 
 
 		 591 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  27.43 
 
 		 609 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  24.16 
 
 		 595 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  24.16 
 
 		 595 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.22 
 
 		 617 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  24.16 
 
 		 595 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.64 
 
 		 612 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  27.24 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  22.11 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.77 
 
 		 601 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.17 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.2 
 
 		 608 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.36 
 
 		 584 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.01 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  21.87 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  22.65 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  23.86 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.09 
 
 		 625 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.29 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.99 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  25.18 
 
 		 596 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  22.11 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.61 
 
 		 625 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  23.68 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  21.78 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.25 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  24.51 
 
 		 602 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  24.51 
 
 		 602 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  24.4 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  22.05 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.54 
 
 		 623 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.06 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  25.34 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  22.79 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>