More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4178 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4178  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 
561 aa  1162    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0341575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  39.6 
 
 
570 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  39.18 
 
 
577 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  36.33 
 
 
577 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  36.61 
 
 
566 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  37.7 
 
 
580 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0974  oligoendopeptidase, M3 family  36.36 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.338378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  35.3 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  34.72 
 
 
548 aa  337  5e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  34 
 
 
548 aa  326  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  36.03 
 
 
569 aa  306  6e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  32.04 
 
 
563 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  32.95 
 
 
563 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  33.27 
 
 
563 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2327  oligoendopeptidase F  32.76 
 
 
563 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  32.33 
 
 
563 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  32.71 
 
 
563 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  32.11 
 
 
563 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  32.11 
 
 
563 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  32.53 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  32.53 
 
 
563 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  33.08 
 
 
554 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2738  oligoendopeptidase F, putative  31.26 
 
 
576 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  32.09 
 
 
555 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  31.44 
 
 
564 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0409  oligoendopeptidase, M3 family  28.64 
 
 
565 aa  210  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  29.35 
 
 
565 aa  208  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2318  M3 family oligoendopeptidase  29.45 
 
 
564 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2632  M3 family oligoendopeptidase  29.05 
 
 
564 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  30.77 
 
 
564 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1229  oligoendopeptidase F  29.32 
 
 
564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1452  oligoendopeptidase F, putative  28.88 
 
 
564 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1426  putative oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000356058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1254  oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1227  oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1492  putative oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1353  oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1389  putative oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3955  putative oligoendopeptidase F  28.88 
 
 
564 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.47699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1252  M3 family oligoendopeptidase  29.1 
 
 
564 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1061  M3 family oligoendopeptidase  28.35 
 
 
564 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2625  M3 family oligoendopeptidase  24.73 
 
 
578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2593  oligoendopeptidase, putative  35.71 
 
 
305 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2453  oligoendopeptidase, M3 family  31.28 
 
 
567 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  24.77 
 
 
548 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  25.64 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2943  oligoendopeptidase, M3 family  28.51 
 
 
564 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00002349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  24.95 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2550  oligoendopeptidase F, peptidase M3 family protein  24.81 
 
 
548 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.970072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  24.2 
 
 
548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  24.39 
 
 
548 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  24.39 
 
 
548 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.29 
 
 
588 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.8 
 
 
591 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.29 
 
 
588 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2457  peptidase M3 family protein  26.64 
 
 
297 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  26.15 
 
 
597 aa  94.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  22.83 
 
 
584 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2980  thimet oligopeptidase  23.93 
 
 
622 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0852464  normal  0.183056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.81 
 
 
620 aa  90.9  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.76 
 
 
615 aa  90.5  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.98 
 
 
601 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1092  oligopeptidase F  26.57 
 
 
600 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.606677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.58 
 
 
625 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.13 
 
 
625 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.2 
 
 
623 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  24.64 
 
 
597 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  23.08 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  23.08 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.66 
 
 
616 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  23.58 
 
 
596 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.99 
 
 
616 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.89 
 
 
609 aa  83.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  23.58 
 
 
612 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  24.41 
 
 
618 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  24.52 
 
 
619 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.63 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  22.64 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0758  oligoendopeptidase F, putative  25.74 
 
 
599 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  24.71 
 
 
592 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.74 
 
 
597 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.53 
 
 
601 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.35 
 
 
616 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  26.06 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  20.6 
 
 
590 aa  78.2  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  22.39 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.55 
 
 
620 aa  77  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  22.05 
 
 
573 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  23.46 
 
 
606 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  22.95 
 
 
606 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.5 
 
 
627 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.85 
 
 
622 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  23.59 
 
 
600 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1306  oligoendopeptidase F  23.75 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479307  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.09 
 
 
600 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  22.4 
 
 
595 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  24 
 
 
598 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  24.17 
 
 
629 aa  75.1  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0955  oligoendopeptidase F, putative  24.23 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.660316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  22.45 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>