More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2627 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 
734 aa  1519    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  99.59 
 
 
734 aa  1511    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.69 
 
 
848 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  49.78 
 
 
709 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  55.26 
 
 
714 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.5 
 
 
726 aa  1174    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  99.05 
 
 
734 aa  1502    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.52 
 
 
712 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.38 
 
 
683 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.79 
 
 
736 aa  865    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  80.52 
 
 
729 aa  1212    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  81.2 
 
 
726 aa  1254    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  92.99 
 
 
742 aa  1415    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  92.59 
 
 
742 aa  1392    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  71.66 
 
 
727 aa  1108    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  99.59 
 
 
734 aa  1510    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  92.86 
 
 
742 aa  1413    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.51 
 
 
718 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  70.56 
 
 
730 aa  1072    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  81.34 
 
 
726 aa  1236    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  81.28 
 
 
725 aa  1223    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.55 
 
 
723 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  46.03 
 
 
722 aa  631  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.03 
 
 
714 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.19 
 
 
723 aa  630  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.97 
 
 
717 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.92 
 
 
716 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.38 
 
 
689 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.78 
 
 
716 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.31 
 
 
733 aa  628  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.41 
 
 
716 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.55 
 
 
716 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.5 
 
 
716 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.41 
 
 
716 aa  622  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.7 
 
 
716 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.33 
 
 
718 aa  616  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.27 
 
 
716 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  48.48 
 
 
675 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.79 
 
 
716 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  45.87 
 
 
693 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.48 
 
 
711 aa  611  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.12 
 
 
689 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  45.81 
 
 
685 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.05 
 
 
722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.37 
 
 
720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.52 
 
 
695 aa  599  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.09 
 
 
687 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.44 
 
 
689 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.68 
 
 
712 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.3 
 
 
718 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.69 
 
 
694 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.15 
 
 
696 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.38 
 
 
696 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.95 
 
 
696 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.08 
 
 
699 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.81 
 
 
683 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.29 
 
 
699 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 
717 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.66 
 
 
697 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 
716 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.26 
 
 
696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 
717 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.18 
 
 
716 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.13 
 
 
699 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.63 
 
 
726 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.22 
 
 
714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  44.91 
 
 
692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.21 
 
 
714 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  41.88 
 
 
694 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.07 
 
 
714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.02 
 
 
711 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.07 
 
 
714 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.26 
 
 
677 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.21 
 
 
714 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.66 
 
 
691 aa  572  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.79 
 
 
695 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  45.16 
 
 
674 aa  568  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.83 
 
 
718 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.69 
 
 
681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  44.02 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.69 
 
 
681 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.54 
 
 
681 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3616  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.05 
 
 
682 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.751531  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.69 
 
 
681 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.54 
 
 
681 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.69 
 
 
681 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.38 
 
 
695 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.54 
 
 
681 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.54 
 
 
681 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  42.69 
 
 
681 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.3 
 
 
682 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.88 
 
 
680 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.09 
 
 
671 aa  555  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.41 
 
 
728 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.14 
 
 
715 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.14 
 
 
681 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.14 
 
 
715 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.63 
 
 
659 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.14 
 
 
715 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.56 
 
 
670 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>