154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2493 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 
621 aa  1292    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  83.14 
 
 
619 aa  1049    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  79.13 
 
 
622 aa  1042    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  55.68 
 
 
615 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  55.28 
 
 
615 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  79.94 
 
 
622 aa  1035    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  54.56 
 
 
615 aa  693    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  77 
 
 
618 aa  976    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  38.55 
 
 
624 aa  423  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  25.15 
 
 
528 aa  64.3  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.69 
 
 
682 aa  61.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  23.27 
 
 
683 aa  60.8  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  22.17 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  23.56 
 
 
699 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.91 
 
 
689 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  27.69 
 
 
577 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.8 
 
 
716 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.96 
 
 
714 aa  58.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.43 
 
 
716 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.43 
 
 
716 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.2 
 
 
716 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  22.77 
 
 
681 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  23.33 
 
 
699 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  21.57 
 
 
676 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.25 
 
 
716 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.25 
 
 
716 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  23.33 
 
 
699 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  23.33 
 
 
699 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  23.33 
 
 
699 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  23.65 
 
 
682 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.41 
 
 
681 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  23.09 
 
 
699 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.12 
 
 
717 aa  54.3  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  24.1 
 
 
700 aa  54.3  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  23.12 
 
 
692 aa  53.9  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  23.54 
 
 
679 aa  53.9  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.01 
 
 
716 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  23.76 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  21.88 
 
 
679 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.22 
 
 
682 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  22.94 
 
 
704 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.01 
 
 
716 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.52 
 
 
689 aa  53.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  22.86 
 
 
699 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  22.99 
 
 
692 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.5 
 
 
694 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.78 
 
 
727 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  21.65 
 
 
682 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  23.24 
 
 
706 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.45 
 
 
718 aa  51.6  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.46 
 
 
730 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.22 
 
 
733 aa  51.6  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.09 
 
 
685 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.53 
 
 
716 aa  51.2  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  22.94 
 
 
704 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.69 
 
 
714 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  20.69 
 
 
714 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.69 
 
 
714 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.69 
 
 
714 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.07 
 
 
715 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.07 
 
 
715 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.07 
 
 
715 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.64 
 
 
695 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  25.45 
 
 
680 aa  50.4  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  22.37 
 
 
694 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  22.67 
 
 
694 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.8 
 
 
720 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  27.11 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.79 
 
 
696 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  22.5 
 
 
681 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  23.51 
 
 
695 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  22.43 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1232  oligopeptidase A  25.17 
 
 
693 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.966663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  22.43 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  22.43 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  22.57 
 
 
678 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.85 
 
 
687 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  22.43 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.06 
 
 
729 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  21.28 
 
 
716 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  28.65 
 
 
749 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  24.27 
 
 
548 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  22.43 
 
 
680 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.54 
 
 
726 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.72 
 
 
696 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  22.03 
 
 
681 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  23.97 
 
 
714 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  23.34 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  22.51 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.8 
 
 
712 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.3 
 
 
734 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  24.05 
 
 
685 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>